在C语言中读取HDF5数据集时,如果遇到数据类型未知的情况,可以采用以下步骤来处理: 基础概念 HDF5(Hierarchical Data Format version 5)是一种用于存储大量数据的文件格式,支持多种数据类型和结构。HDF5文件中的数据集(Dataset)可以包含不同类型的数据,如整数、浮点数、字符串等。 相关优势 灵活
hid_t h5f=H5Fopen(FILE_NAME.c_str(), H5F_ACC_RDONLY,H5P_DEFAULT ); hid_t group, subgroup, gcp1,dataset,datatype; herr_t status; H5G_info_t ginfo; ssize_t size; hsize_t i,dims; char* name; dou…
class GetHdf5DataSet { #region 获取数据集数据,主要包含int,float,double private Array _dataSet; public Array get_Hdf5DataSet { get { return _dataSet; } } /// /// 得到int类型的数据集 /// ///文件名称,包含路径 ///数据集所在的群组 ...
我有一个包含Nvl 的数组,该数组已经写入hdf5文件。我可以通过c++读取整个数据(下面的片段在hdf5中,但使用C版本的hdf5 API的答案也同样受欢迎)dset.read(vl, VarLenType(&PredType:NATIVE_INT)); 但是,如果我只想读取每个可变长度对象的长度,即vl[i].len (对于i=0到Nvl-1),那么我如何才能不同时读取数据vl[...
export PATH=/home/ydn/opt/software/hdf5-1.10.6/build/bin:$PATH export LD_LIBRARY_PATH=/home/ydn/opt/software/hdf5-1.10.6/build/lib:$LD_LIBRARY_PATH 6. 安装PNETCDF 实际上这个是PnetCDF: A Parallel I/O Library for NetCDF File Access并行文件netcdf的输入输出和读写,尤其是大GB文件。
H5F_ACC_RDWR文件已经存在,程序有权读和写。创建HDF5文件官方代码如下:(google一下“h5_crtfile.c”) 创建数据集数据集是HDF5里面的主要组成部分,数据集里面盛放的是相关数据。同一个HDF5文件里面不同的数据集是相互独立的(所以我们才能够用不同的数据集存放不同的数据)如果把 HDF5文件比喻为仓库,那么每个数据集...
此问题的故障点在于未使用正确的文件名,具体的架构图如下所示,标记出了故障点: C4Context title 系统架构图 user(User) --> system(System) system --> dataStore(HDF5 File) dataStore -down-> api(API Service) api -down-> worker(Worker) 为了解决这个问题,我们整理了一些简单的分步操作指南,以确保在以后...
HDF5文件是以类似于文件系统的分层结构组织的。它由组、数据集和属性组成。组和数据集类似于目录和文件,属性是键值对。一个.cool文件包括四个组:染色体、二元组、像素和索引。每个组用作表格,其中等长数组类型的数据集被用作字段。像素组包含了稀疏矩阵表中的接触矩阵,而二元组存储了二元组的基因组坐标和染色体组...
MAT File I/O Library 简称 matio,是用于在c/c++中读取和写入matlab中mat文件的一个库。 本篇记录windows下编译matio 64位库的过程,所用的工具为:VS2013 CMake2.8 1. 编译 zlib (使用版本为:1.2.8) 使用CMake生成vcproj项目 VS2013编译zlib 2. 编译hdf5(使用版本为: 1.8.9) ...
h5py是hdf5文件库留给python的接口,这个配置类似于pyhdf。可以从这里进行下载,同样需要注意版本问题。更多的测试example和使用方法可以访问这里http:///p/h5py/wiki/HowTo#Examples_in_the_source_distribution 这是python中读取hdf4和hdf5的基础功能,开始想使用gdal来完成读取配置的,但是可能是gdal版本太高还是什么原因...