含义bwa -r参数含义bwa -r参数 bwa 是一个用于将测序得到的原始读段(reads)比对(mapping)到参考基因组的软件。其参数 -r 通常用于指定一个跳过的区域。 当使用-r 参数时,bwa 会跳过在给定范围内的所有位置的比对尝试。这对于那些已知含有大量错误或重复序列的区域特别有用,因为在这些区域进行比对可能会引入误导...
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其中,r参数是bwa中一个重要且常用的参数,本文将重点介绍r参数的含义和使用方法。 一、bwa简介 bwa是一个常用的序列比对工具,它基于Burrows-Wheeler变换(BWT)和后缀数组(Suffix Array)等算法,能够在较短的时间内进行大规模的序列比对。bwa提供了三个子程序:bwa aln、bwa mem和bwa samse/sampe,它们都有不同的适用...