bsub -q queue_name 使用-q选项可以将作业提交到指定的队列上运行。 4.指定作业资源: bsub -n num_cores 使用-n选项可以指定作业所需的计算核心数量。 作业控制 5.查看作业状态: bjobs [job_id] 使用bjobs命令可以查看当前用户的作业状态,可选的job_id参数可以过滤显示指定作业的状态。 6.终止作业: bkill ...
#BSUB -R “span[ptile=1]” 指定作业在单个节点上使用的核心数为1 #BSUB -q gpu -q 指定作业提交到gpu队列 (一般个gpu,mic即可) #BSUB -o hello.out 标注输出文件(有错误 输出为空) #BSUB -e hello.err 错误输出文件(有错误这个文件里会给出,无错误为空) ./hello 指定输出路径 5 运行脚本文件 ...
bjobs -u username | grep PSUSP|awk '{print $1}' |xargs bkill 6.1.2 所有用户:bjobs -u all -p -q normal | grep PSUSP|awk '{print $1}' |xargs bkill(-p参数,可有可无,不影响命令执行结果) PS:常用LSF命令(更详细命令使用可参考LSF的PDF手册) bpeek -f 作业号 查看任务日志,显示处于运...
#!/bin/bash --login #BSUB -q q_ab_mpc_work #BSUB -J psipred #BSUB -W 01:00 #BSUB -n 64 #BSUB -o psipred.out #BSUB -e psipred.err module load compiler/gnu-4.8.0 module load R/3.0.1 export OMP_NUM_THREADS=4 code=${HOME}/Phd/script_dev/rfpipeline.sh MYPATH=$HOME/Phd/sc...
1. 在运行目标命令前使用source命令加载虚拟环境。 例如下面要运行base环境中的spades.py命令: #BSUB -q 5220r#BSUB -n 1,48#BSUB -J spades_hq#BSUB -o spades_hq.out#BSUB -e spades_hq.err# >>> 激活base环境 <<<source/fsa/home/mw_shenw/install/miniconda3/bin/activate base# >>> 运行spade...
在Linux下,bsub命令是用于提交批处理作业的命令。它通常与其他工具和命令一起使用,以便在后台运行长时间运行的任务。 bsub命令的基本语法是: bsub [选项] 命令 以下是一些常用的选项: J <job_name>:指定作业的名称。 q <queue_name>:指定要将作业提交到的队列。 n :指定作业所需的处理器核心数。 o <output...
目前我发现想要用bsub命令指定在特定的conda虚拟环境中运行脚本有两种办法:1. 在运行目标命令前使用source命令加载虚拟环境。...例如下面要运行base环境中的spades.py命令:#BSUB -q 5220r#BSUB -n 1,48#BSUB -J spades_hq#BSUB -o spades_h...
#BSUB -q smp (选择队列) #BSUB -app amber (应用) #BSUB -o %J.out (结果输出文件,以作业号为文件名) #BSUB -o %J.err (错误输出文件,以作业号为文件名) #BSUB -a openmpi (编译器) #BSUB -n 8 (计算核心的数量) mpirun.lsf sander.MPI -O -i min_2ojn.in -o min_2ojn.out -p 2...
星闪网关路由的问世,象征星闪时代真正来临!#华为推出首款星闪网关路由 #华为首款星闪路由来了 #华为路由首发星闪网关技术 关注 赞 评论 华为Mate 70 Pro+ 首摔 遥遥领先!华为Mate70系列正式发布#台海时刻 #海峡新干线 #华为mate70 享界S9 Ultra长航版,续航不再焦虑!100kWh大电池,816公里续航,智能座舱,安...
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