bsub -q queue_name 使用-q选项可以将作业提交到指定的队列上运行。 4.指定作业资源: bsub -n num_cores 使用-n选项可以指定作业所需的计算核心数量。 作业控制 5.查看作业状态: bjobs [job_id] 使用bjobs命令可以查看当前用户的作业状态,可选的job_id参数可以过滤显示指定作业的状态。 6.终止作业: bkill ...
#BSUB -R “span[ptile=1]” 指定作业在单个节点上使用的核心数为1 #BSUB -q gpu -q 指定作业提交到gpu队列 (一般个gpu,mic即可) #BSUB -o hello.out 标注输出文件(有错误 输出为空) #BSUB -e hello.err 错误输出文件(有错误这个文件里会给出,无错误为空) ./hello 指定输出路径 5 运行脚本文件 ...
2.2 相关参数: -q 选择作业提交的队列queue-i 指定输入文件-I 交互模式,此时终端不能输入-J 指定作业名称-n 指定作业需要的CPU核心数,LSF中一般称之为slot-R span[hosts=1] 指定作业只能在单个节点运行,不能跨节点(跨节点作业需要MPI支持,生物中比较少),-R 可以使得作业在需要满足某种条件的节点上运行-o 作...
1. 在运行目标命令前使用source命令加载虚拟环境。 例如下面要运行base环境中的spades.py命令: 代码语言:shell 复制 #BSUB -q 5220r#BSUB -n 1,48#BSUB -J spades_hq#BSUB -o spades_hq.out#BSUB -e spades_hq.err# >>> 激活base环境 <<<source/fsa/home/mw_shenw/install/miniconda3/bin/activate ...
在Linux下,bsub命令是用于提交批处理作业的命令。它通常与其他工具和命令一起使用,以便在后台运行长时间运行的任务。 bsub命令的基本语法是: bsub [选项] 命令 以下是一些常用的选项: J <job_name>:指定作业的名称。 q <queue_name>:指定要将作业提交到的队列。 n :指定作业所需的处理器核心数。 o <output...
例如下面要运行base环境中的spades.py命令：#BSUB -q 5220r#BSUB -n 1,48#BSUB -J spades_hq#...
#BSUB -q smp (选择队列) #BSUB -app amber (应用) #BSUB -o %J.out (结果输出文件,以作业号为文件名) #BSUB -o %J.err (错误输出文件,以作业号为文件名) #BSUB -a openmpi (编译器) #BSUB -n 8 (计算核心的数量) mpirun.lsf sander.MPI -O -i min_2ojn.in -o min_2ojn.out -p 2...
bsub -q mc -clusters local_c1 rmt_c1 rmt_c2 To ignore preference for the local cluster (because the local cluster is always tried first, even though remote clusters have higher job level preference) and try remote clusters: bsub -q mc -clusters local_c1 rmt_c1+2 rmt_c2+1 To have the...
参考试剂盒说明书,采用Omega6837-01植物总RNA提取试剂盒提取不同样品的总RNA;将提取的总RNA进行琼脂糖凝胶电泳检测其完整性,同时用QuawellQ5000微量分光光度计测定其浓度及OD 260 / 280 值。 电泳检测结果(图1)分析表明:电泳有三条带,28S和18S条带清晰,28S条带的亮度大约是18S的2倍;QuawellQ5000测定结果表明...
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