-P 指定project name,如果我们需要统计某个项目消耗的计算资源,如CPU时等,可以将相关的作业都指定为同一个project name,然后根据project name统计资源消耗; -r rerun选项,即作业失败后自动重新运行,提交大量作业时此选项比较有用; example: /tools/xxx/xxx/bsub -q normal -P AnIP -K -C 0 上面-q 后面跟q...
log”。该命令申请12核、16GB内存，日志存指定路径。跨节点并行任务常用“bsub -n 24 -R ’span[ptile=6]’”。ptile=6表示每节点分配6核，总需求24核时自动分配4节点。注意事项 资源申请过大会降低调度成功率，建议通过历史任务数据估算合理值。内存单位需明确标注MB/GB，默认单位可能因集群配置变化。
1、作业每个进程消耗10GB内存。 2、cpu核心越多越好(<200核心)。 计算节点的配置 1、cpu核心:32个。 2、内存:96GB。 bsub 参数设置 为避免默认状态下提交,作业运行在一个节点上的进程数过多,超过节点所能提供的内存容量。使用如下参数: -R "span[ptile=5] select[mem>50000]" 参数说明 1、ptile=5:每...
#BSUB -R "span[ptile=6]" (每个节点用6个计算核心) mpirun.lsf mdrun -v -s md.tpr -c md.gro -e md.edr -o md.trr -g md.log MS5.5 (把下面内容编写成脚本) #!/bin/sh #BSUB -q parallel #BSUB -app ms #BSUB -o %J.out #BSUB -e %J.err #BSUB -n 12 #BSUB -R "span[...
#BSUB-R"span[ptile=6]" (每个节点用6个计算核心) mpirun.lsfmdrun-v-smd.tpr -cmd.gro -emd.edr-omd.trr-gmd.logMS5.5 (把下面内容编写成脚本) #!/bin/sh #BSUB-qparallel #BSUB-appms #BSUB-o%J.out #BSUB-e%J.err #BSUB-n12
问UNIX和LINUX bsub命令-W限制ENw 命令用于显示已经登陆系统的用户列表，并显示用户正在执行的指令。执行...
If you submit a job with the-Poption ofbsub, the job belongs to the project specified through the-Poption. Where defined From the command line, or through the-Poption ofbsub Example LSB_DEFAULTPROJECT=engineering See also DEFAULT_PROJECTinlsb.params, the-Poption ofbsub ...
http://www.ssc.NET.cn/ 上涨超算中心 LSF简介 LSF(Load Sharing Facility)是分布资源管理的工具,用来调度、监视、分析联网计算机的负载。 目的 通过集中监控和调度,充分共享计算机的CPU、内存、磁盘、License等资源 一组安装了LSF软件的计算机组成一个Cluster ...
elif p.returncode != 0: if(res): sys.stderr.write(res) if(err): sys.stderr.write(err) raise BSubException(command + "[" + str(p.returncode) + "]") if not (check_str in res and p.returncode == 0): raise BSubException(res) # could return job-id from here return res if...
Security Insights Additional navigation options master 6Branches3Tags Code bsub python wrapper to submit jobs to bsub (and later qsub) Authors @brentp, @brwnj >>>frombsubimportbsub>>>sub=bsub("some_job",R="rusage[mem=1]",verbose=True)# submit a job via call'ing the sub object with th...