指定CSM 作业所需的计算节点数。 类别 资源(resource) 概要 bsub -nnodesnum_nodes 有冲突的选项 请勿与-csm y选项配合使用。 描述 此选项用于轻松方式LSF作业提交,以与 IBM Cluster Systems Manager (CSM) 集成软件包一起运行。 缺省值 1
-nnodes 指定CSM 工作所需的計算節點數目。 類別 資源 用法概要 衝突的選項 請勿與-csm y選項搭配使用。 說明 此選項適用於使用 IBM Cluster Systems Manager (CSM) 整合套件執行的簡易模式LSF工作提交。 預設值 1
1. 在运行目标命令前使用source命令加载虚拟环境。 例如下面要运行base环境中的spades.py命令: 代码语言:shell 复制 #BSUB -q 5220r#BSUB -n 1,48#BSUB -J spades_hq#BSUB -o spades_hq.out#BSUB -e spades_hq.err# >>> 激活base环境 <<>> 运行spades.py <<<spades.py--careful-18456_HQ_R1.fq...
# BSUB -W 00:2 -w 指定运行时间 00:2 小时:分钟 #BSUB -n 1 -n 1 作业需要使用的核心数为1 #BSUB -R “span[ptile=1]” 指定作业在单个节点上使用的核心数为1 #BSUB -q gpu -q 指定作业提交到gpu队列 (一般个gpu,mic即可) #BSUB -o hello.out 标注输出文件(有错误 输出为空) #BSUB -e...
例如下面要运行base环境中的spades.py命令：#BSUB -q 5220r#BSUB -n 1,48#BSUB -J spades_hq#...
-n 指定作业需要的CPU 核 -J 作业的名字 -m 丢job到指定的机器上 -I 交互式模式,此时终端不能输入 -Ip 提交job的时候提供虚拟terminal支持,如vim这种应用是需要terminal支持的. -R 指定为当前任务的资源需求。 示例:任务需要10G内存 ##简单提交任务 ...
bsub -n num_cores 使用-n选项可以指定作业所需的计算核心数量。 作业控制 5.查看作业状态: bjobs [job_id] 使用bjobs命令可以查看当前用户的作业状态,可选的job_id参数可以过滤显示指定作业的状态。 6.终止作业: bkill job_id 使用bkill命令可以终止指定作业的运行。 7.暂停和恢复作业: bstop job_id bresu...
#BSUB -o %J.out (结果输出文件,以作业号为文件名) #BSUB -e %J.err (错误输出文件,以作业号为文件名) #BSUB -n 12 (计算核心的数量) #BSUB -R "span[ptile=6]" (每个节点用6个计算核心) mpirun.lsf mdrun -v -s md.tpr -c md.gro -e md.edr -o md.trr -g md.log MS5.5 (把下...
bsub -n 2 -m "host1 host2! hostgroupA! host3 host4" my_parallel_job LSF runsmy_parallel_jobaccording to the following steps: LSF selects either host2 or a host defined inhostgroupAas the first execution host for the parallel job. Note First execution host candidates specified at th...
awsbsub [-h] [-jnJOB_NAME] [-cCLUSTER] [-cf] [-wWORKING_DIR] [-pwPARENT_WORKING_DIR] [-ifINPUT_FILE] [-pVCPUS] [-mMEMORY] [-eENV] [-ebENV_DENYLIST] [-rRETRY_ATTEMPTS] [-tTIMEOUT] [-nNODES] [-aARRAY_SIZE] [-dDEPENDS_ON] [command] [arguments[arguments...]] ...