BSP直接测序 技术简介 样本要求与建议 分析与结果 亚硫酸氢盐处理后测序法(bisulfite sequencing PCR,BSP)是检测基因DNA甲基化修饰的经典方法,其原理为:用亚硫酸氢盐处理基因组DNA,所有未发生甲基化的胞嘧啶(C)被转化为尿嘧啶(U),而甲基化的胞嘧啶则不变。基因组DNA经亚硫酸氢盐处理后,设计BSP引物扩增目的片段...
BSP克隆测序法(BisulfiteSequencingPCR,BSP) BSP实验原理: BSP克隆测序法,是目前甲基化检测的金标准。用亚硫酸氢盐处理基因组DNA,所有未发生甲基化的胞嘧啶被转化为尿嘧啶,而甲基化的胞嘧啶不变;随后再CpG岛两端设计引物进行PCR,将目的产物纯化后进行TA克隆,每个克隆挑取阳性克隆测序,最后将测得的序列与原始序列比对...
BSP甲基化测序(Bisulfite Genomic Sequencing PCR)的原理通过对基因组DNA进行重亚硫酸盐处理,非甲基化的胞嘧啶被脱氨基而转变成尿嘧啶,在随后的PCR反应中尿嘧啶转变成胸腺嘧啶,而甲基化的胞嘧啶不能被脱氨基,在反应完成时被保留,我们将扩增得到的PCR产物进行TA克隆测序,就可以分析甲基化发生的具体情况。该方法实验结果...
基因组DNA经亚硫酸盐处理后,设计BSP引物扩增目的片段,此时尿嘧啶(U)全部转化为胸腺嘧啶(T),最后对PCR产物进行测序就可以判断CpG位点是否发生甲基化。 BSP实验流程: DNA抽提和亚硫酸盐处理都可参考相应的试剂盒进行操作 引物设计网站网址如下:http://www...
多重扩增测序技术具有原理简单、通量高的特点,是对于中等数量位点(10-50),较大样本量(>200)的高性价比芯片数据验证方案。本方案采用独特的多重BSP扩增试剂与多重BSP引物设计相结合的方案,可以得到目的DMP位点或DMR区域的甲基化修饰细节,可在单碱基分辨率下分析甲基化修饰程度与甲基化单体型结果。
#BSP甲基化测序1个 #亚硫酸氢盐处理1个 #甲基化5个 亚硫酸氢盐处理后测序(bisulfite sequencing PCR,BSP)法是检测基因甲基化的经典方法,其原理为:用亚硫酸氢钠修饰处理基因组DNA,所有未发生甲基化的胞嘧啶(C)被转化为尿嘧啶(U)而甲基化的胞嘧啶则不变。
BSP测序 甲基化检测方法(亚硫酸氢盐修饰后测序法)甲基化是目前的研究热点,就我所做的一点工作并其中一点心得,与大家分享。希望能够对大家有所帮助。第一部分 基因组DNA的提取。这一步没有悬念,完全可以购买供细胞或组织使用的DNA提取试剂盒,如果实验室条件成熟,自己配试剂提取完全可以。DNA比较稳定,只要在操作...
因为BSP的引物设计太难了,所以我想先把目的基因给扩出来,然后再进行亚硫酸氢盐处理,就是把正常的顺序给反过来,不知道会产生什么结果? 扫码下载作业帮拍照答疑一拍即得 答案解析 查看更多优质解析 举报 PCR的时候甲基化C和非甲基化的C无差别的被扩增为非甲基化的C,再做下去就没意义了. 解析看不懂?免费查看...
bsp甲基化扩增得到的pcr产物可否直接测序,为什么需要构建ta克隆后测序960化工网专业团队、用户为您解答,有bsp甲基化扩增得到的pcr产物可否直接测序,为什么需要构建ta克隆后测序的疑问
方法:采用重亚硫酸盐测序PCR(bisulfite genomic sequencing PCR,BSP)联合TA克隆测序检测胰腺癌细胞株PANC-1及胰腺癌组织、癌旁组织及正常胰腺组织中RASSF1A启动子区CpG岛的甲基化状态,以甲基化酶抑制剂5-aza-2-deoxycitydine(5-aza-dC)处理PANC-1,观察处理前后甲基化率变化情况,逆转录PCR观察RASSF1A的mRNA表达...