BSgenome.Hsapiens.UCSC.hg19 包是基于IRanges，GenomeInfoDb，GenomicRanges， Biostrings，XVector这些包所所构建的。Biostrings 是 BSgenome.Hsapiens.UCSC.hg19 的一个基础包，其中的 matchPattern() 函数用于根据设定的 pattern 寻找目标 string 的起始和结束位点。结合 BSgenome.Hsapiens.UCSC.hg19 包的基...
For example, if you've installed the BSgenome.Hsapiens.UCSC.hg19 package, load it and see the Note section in 驴BSgenome.Hsapiens.UCSC.hg19`.Marc Carlson M Carlson 被引量: 0发表: 0年 meRbund For example, if you've installed the BSgenome.Hsapiens.UCSC.hg19 package, load it and see the...
DNAString生成DNA对象,dna2rna()转换为RNA,transcribe()将dna转录成rna,rna2dna()rna转换成DNA,cDNA()对rna逆转录得到cDNA,codones查看rna三联子密码,complement()dna的互补链,reverseComplement()dna的反向互补链,reverse()dna的反向序列。 指定文件目录:filepath<-system.file("extdata","someORF.fa",package="...
BSgenome.Hsapiens.UCSC.hg19包是基于IRanges,GenomeInfoDb,GenomicRanges, Biostrings,XVector这些包所所构建的。 Biostrings是BSgenome.Hsapiens.UCSC.hg19的一个基础包,其中的matchPattern()函数用于根据设定的pattern寻找目标string的起始和结束位点。结合BSgenome.Hsapiens.UCSC.hg19包的基因组数据可用于建立一些数据集,如Cp...
It is expected that users may have previously made seen packages like org.Hs.eg.db and TxDb.Hsapiens.UCSC.hg19.knownGene. Packages like these two are ... ULAR Org 被引量: 0发表: 0年 [BioC] biocLite("TxDb.Hsapiens.UCSC.hg19.knownGene") fails It is expected that users may have previousl...