BSA-seq性状定位技术流程 | BSA专题 联川生物 一个提供科研入门学习资源、经验的平台。 12 人赞同了该文章 1.DNA样本提取与检测 首先,使用DNA提取试剂盒采用标准流程提取DNA。极端性状的2个亲本可直接提取DNA并质检,而子代样本在提取DNA并质检后还要进行等量混合的操作,构建混池样本(每个池建议至少20个样本以上...
然而,根据对已报道的104篇研究论文,共包括137个实验的调查结果,BSA-seq检测QTL的能力在实际应用中却不尽人意,大多数实验只能检测到1~3个QTL,没有发挥出BSA-seq定位QTL的潜力。 近日,福建农林大学在吴为人教授团队The Crop Journal在线发表了题为“Multi-environment BSA-seq using large F3 populations is able to...
综上所述,我们利用基于GBS的BSA-seq方法鉴定了CaPRR2为c1的候选基因。CaPRR2与质体的发育和色素的生物合成有关,进而控制辣椒果实的颜色。 总结:该基因定位的实验设计包括:GBS based-BSAseq +Gene Clone+qRT –PCR+TEM等分子实验技术及生理检测实验技术快速确定了候选基因。其中,BSA-seq与GBS测序的结合可以有效地缩...
因此,为了小麦抗条锈病品种培育,需要定位和克隆发掘更多的条锈病抗病基因。 本研究通过正向遗传学和BSA-seq技术结合的方法,从乌拉尔图小麦中快速定位一个新的小麦条锈病抗病基因位点,初步定位在7AS染色体的35 Mb的物理区间,在该区间尚未有报道...
服务与产品 基因组测序 简化基因组测序 基因组重测序 BSA+Target-seq 快速精细定位 转录组测序 基因分型 特色服务BSA+Target-seq 快速精细定位合作伙伴 关于我们 公司介绍 合作文章 公司新闻 招贤纳士 联系我们 在线留言 技术平台 HiSeq X Ten 测序平台 MiSeq 高通量测序平台 PacBio 三代测序平台 服务与产品 基...
为探索BSA-seq用于辐射诱变突变体的基因定位的可行性，本研究通过辐射诱变筛选得到一个拟南芥突变体，将其与亲本杂交，在F2代分离群体中根据表型筛选单株，构建两个极端表型的子代混池；将两个子代混池与亲本混池进行全基因组测序，使用MutMap、QTL-seq和GPS等多种BSA-seq定位策略对其进行定位分析。结果表明，多种BSA...
研究通过QTL定位和BSA-seq挖掘到控制莲花色的NnMYB5及其靶基因NnGST2,揭示了亚洲莲花瓣颜色形成的调控机制。研究通过红色和白色亚洲莲F2群体的QTL定位,明确了控制亚洲莲花瓣颜色分化的候选基因NnMYB5,并对213个莲种质资源进行基因分型发现包含NnMYB5基因的一个80 kb存在/缺失结构变异(PAV)与花瓣颜色关联。进一步,转...
位点突变(sp);2个为新基因(moc,psd5),其突变皆由染色体结构变异所致.两个实例分析结果表明,本文建立的BSA-seq方法是一个快速且准确率很高的基因定位方法,不仅可以检测常见的突变类型,还可以检测染色体结构变异.在以往的BSA-seq定位方法中,还没有有关染色体结构变异分析的报道.因此,本方法可广泛应用于主基因定位中...
BSA+Target-seq 快速精细定位 BSA+Target-seq 快速精细定位业务,9月15日前签订协议,2020年内实施业务并打款,执行9折优惠。
最近逛Github,发现一个新出的BSA自动化流程,就叫QTL-seq,看起来还蛮简单方便的,所以搞了一下试试。 BSA原理就不多说了,在实际操作中,高、低池子至少得两个,然后就是可以选择测还是不测亲本。这套流程是需要亲本测序数据的,还有一些流程是不需要的,例如DeepBSA、QTLseqr等,所以根据自己试验经费来定就好。个人觉...