BSA-Seq(Bulked Segregant Analysis by Sequencing)是一种结合了集群分离分析法(Bulked Segregant Analysis, BSA)和高通量测序(Next-Generation Sequencing, NGS)技术的分析方法,旨在快速定位与特定性状相关的基因或QTL(Quantitative Trait Locus)。BSA-Seq通过分析在遗传群体中表现极端性状的个体(如高表型与低表型)的DNA...
BSA-Seq是一种结合集群分离分析法与高通量测序技术的分析方法，旨在快速定位与特定性状相关的基因或QTL。BSA-Seq分析主要步骤包括群体构建、表型鉴定、DNA样本提取与混池构建、高通量测序和生物信息学分析。以该研究为例，通过高通量测序寻找变异位点与表型数据关联，发现茶树中CsANS和CsMYB75存在大量SNP和IN...
答: BSA性状定位是基于SNP,通过比较SNP频率差异进行分析的, EMS诱发的是点突变,所以EMS诱发的突变适合这种分析方式;其他的诱变方式诱发的大部分是结构变异,在SNP水平上可能找不到导致目标性状差异的区域,所以不适合SNP频率分析的方法。 11,全基因组(WGS ) BSA性状定位与转录组(RNAseq )进行性状定位的比较。 答: ...
BWA：用于比对 SAMtools：用于处理SAM/BAM文件 GATK：用于变异检测 QTL-seq：用于QTL分析 R：用于统计分...
什么是BSA-Seq？BSA-Seq（Bulked Segregant Analysis by Sequencing）是一种结合了集群分离分析法（Bulked...
4. 准备输入文件用于QTL-seq分析 将变异文件转换为所需的格式，通常是表格格式，包含以下字段：染色体 ...