RNA-Seq分析，是从基因转录水平的层面揭示基因之间的调节机制对生物表型导致了哪些结果，它非常适合用于研...
近日,《生物技术通报》在线发表了《基于BSA-seq和RNA-seq挖掘水稻株高相关QTL》文章。本研究使用籼稻油占8号和广西普通野生稻构建的CSSL群体以及现代分子生物学技术,对广西普通野生稻进行研究,通过二代测序和混池分析方法,鉴定广西普通野生稻基因组...
基于RNASeq和BSASeq的棉花缩节胺敏感基因的鉴定及功能研究 摘要:棉花Gossypium hirsutum L.是全球重要的经济作物之一,但缩节胺对棉花的抑制效果一直是棉花栽培中的一个难题。为了了解缩节胺敏感基因的表达模式,本研究
进一步作者对水稻进行了冷胁迫处理并且开展RNA-seq以精细定位耐冷基因。RNA-seq显示在这98个注释基因中,87个基因在冷胁迫下表达,而这其中50个基因差异表达。GO和KEGG分析定位到9个通路包含10个差异表达基因,QRT-PCR进一步验证其功能。 同样使用RNA-seq辅助BSA-seq鉴定功能基因的案例还有鉴定花菜早熟基因。Honghui Gu等...
NGS)和 混池分析(bulk segregation analysis, BSA)方法,鉴 定广西普通野生稻基因组中与株高相关的 QTL,进 而筛选出在株高调控中可能起到关键作用的候选基 因.同时,运用 RNA-seq 分析进一步验证这些候选 基因在株高调控过程中的表达量与水平,为进一步 探究水稻株高调控机制提供了重要的理论指导和研 究思路,为培...
研究以“紫娟”和“金萱”的杂交后代为对象，利用BSA-Seq、BSR-Seq和RNA-Seq技术探究茶树“紫化”关键位点，对花青素生物合成具有重要参考价值。研究指出富含花青素的“紫茶”具有更多保健作用，是当前关注热点。通过在“紫娟”和“金萱”的杂交F1代中，选择30个个体进行分析，发现紫叶个体与绿叶个体间存在...
用30粒透明F2和30粒不透明F2籽粒制备了2个RNA池,进行BSR-seq定位,候选基因定位到4号染色体(B73 RefGen_v3)的35 - 42mb区域(图4B),共147个基因。这些基因的功能注释鉴定GRMZM2G138060为糖1 (Su1)基因,对玉米籽粒透明度至关重要。将F2透明粒系与携带su1su1纯合突变的玉米系T9杂交,生成的杂交种的晶粒是...
Identification of Rice Plant Height-associated QTL Using BSA-seq and RNA-seq WU Yuan-ming, LIN Jia-yi, LIU Yu-xi, LI Dan-ting, ZHANG Zong-qiong, ZHENG Xiao-ming, PANG Hong-bo 生物技术通报 . 2023, (8): 173 -184 . DOI: 10.13560/j.cnki.biotech.bull.1985.2023-0386 ...
然后通过极端表型混池测序分析(BSA测序)、图位克隆、RNA-seq数据及RNAi遗传验证克隆到这个硬质QTL,Ven1。进一步研究发现,Ven1通过调节类萝卜素的含量和组分影响玉米籽粒质地:高水平的非极性胡萝卜素(主要是β-胡萝卜素)似乎可以阻止种子成熟脱水过程中淀粉体膜的破裂并影响胚乳细胞中脂质的含量和组成;这打乱了SGs和...
基于BSA-Seq和RNA-Seq方法鉴定大豆抗豆卷叶螟候选基因 曾维英**赖振光**孙祖东*杨守臻陈怀珠唐向民 广西农业科学院经济作物研究所 / 农业农村部西南玉米大豆间套作区农业科学观测实验站, 广西南宁 530007 摘要: 豆卷叶螟(Lamprosema indicata Fabricius)是重要的大豆食叶性害虫, 挖掘大豆抗豆卷叶螟相关基因对大豆抗 ...