BS-seq全称是Bisulfite sequencing,其原理很简单,就是原始DNA序列在被亚硫酸盐处理后,未甲基化的C会变成U(随后的DNA复制中变成T),而甲基化的C(包括5mC, 5hmC)则不受改变。这是BS-seq的核心点,之后的序列比对也都是基于此。 3. BS-seq的比对方法 目前有很多BS-seq数据比对的方法,最经典的方法就是BSMAP,参...
BS-seq的原理和比对方法在DNA甲基化研究中起到了关键作用，通过亚硫酸盐处理和高通量测序技术，研究人员能够获得基因组中Cytosine位置的详细甲基化信息。BS-seq的独特之处在于其通过映射比对处理特定的甲基化测序数据，为理解表观遗传修饰提供了一个有力的工具。
亚硫酸氢盐测序 (BS-seq) 一直被认为是 DNA 甲基化分析的金标准;然而,亚硫酸氢盐处理的剧烈条件对 DNA 造成的损伤巨大,从而导致序列多样性较差,目标富集偏差以及较高的测序误差。这些缺点限制了其在低起始量 cfDNA 分析中的应用。与 BS-seq 相比,相对温和的酶法甲基化测序 (EM-seq) 很可能是 cfDNA 甲基化检...
mRNA-seq 测序与 分析采购项目网上竞价公告 福建省新卫招标代理有限公司现邀请合格的供应商对以下采购项目进行网 上竞价。 1 、项目编号: FJXW(JJ)20240 57 2 、项目名称: 福建农林大学 6 个烟草样 BS-seq 和 mRNA-seq 测序与分析采 购项目 3 、竞价采购标的名称、数量及技术参...
产品货号: BS-SEQ-10 分散溶剂: 水 固体浓度: 2mg/ml 磁珠粒径: 300nm 推荐用量: 10ul/T 储存环境: 4-8℃ 包装: pp瓶 价格说明 价格:商品在平台的展示标价,具体的成交价格可能因商品参加活动等情况发生变化,也可能随着购买数量不同或所选规格不同而发生变化,如用户与商家线下达成协议,以线...
正文内容 福建农林大学供应商服务平台 - 福建农林大学6个烟草样BS-seq和mRNA-seq测序与分析采购项目(第三次)(WJ2024061(第三次))采购公告.pdf 潜在供应商最新招标 招标单位:福建农林大学共8503条查看 福建农林大学2024年10月政府采购意向 采购意向 福建省|福州市|仓山区 相同招标单位 预算2万元 招标单位:福建农林...
***供应商服务平台 - ***6个烟草样BS-seq和mRNA-seq测序与分析采购项目(第三次)(WJ***061(第三次))采购公告.pdf 附件(1) 福建农林大学供应商服务平台 - 福建农林大学6个烟草样BS-seq和mRNA-seq测序与分析采购项目(第三次)(WJ2024061(第三次))采购公告.pdf下载预览 招标进度...
其中,RNA-BS-seq 是⼀种能够从单碱基分辨率⽔平检测 m5C 的强有⼒的技术。该技术利⽤重亚硫酸盐处理 RNA,使RNA 上没有发⽣修饰的 C 被转化为 U,⽽发⽣ m5C 修饰的 C 碱基则保持为 C。经过 PCR,U 转变成 T,这样便将 m5C 与C 区分开来。结合⾼通量测序,就可以从转录组范围检测 m5C 修饰...
BS-seq是将bisulfite处理与高通量测序相结合,从而检测基因组DNA分子中每一个甲基化位点的状态。 原理 以bisulfite处理基因组DNA,发生甲基化的C碱基无变化,而未发生甲基化的C碱基会脱氨变成U,针对改变后的DNA序列设计特异性引物,并进行PCR扩增。PCR产物中原先未发生甲基化的C变成T,从而可以与发生甲基化修饰的C碱基区...
亚硫酸氢盐测序(BSseq)处理是最繁琐的下一代测序(NGS)应用程序之一。 尽管可以使用某些BSseq处理工具,但它们分散,需要令人费解的参数并且对运行时间和内存使用有严格的要求。 我们已经开发了P3BSseq,这是一个并行处理管道,可快速,准确和自动地分析BSseq读数,以修整,对齐,标注,记录中间结果,执行亚硫酸氢盐转化质量...