基于结构的药物设计中一项重要的任务是预测配体在靶体口袋中的结合姿态,然而当前已报道的打分函数通常受限于精度,或是局限于单一的输出,比如仅预测构象姿势的偏差(RMSD),结合强度(pKd)或是基于残基-原子间距离分布的统计势。本文介绍的是近期发表在国际知名生物信息学期刊《Briefings in Bioinformatics》上的一篇题为《...
本文提出了一种属性引导的原型网络 (attribute-guided prototype network, APN) 来解决这一问题。APN首先引入了一种分子属性提取器,该提取器通过考虑7个基于圆的指纹、5个基于路径的指纹和2个基于子结构的指纹,不仅可以提取3种不同类型的指纹属性(单指纹属性、双指纹属性和三重指纹属性);还可以自动从自监督学习方法...
国际简称:BRIEF BIOINFORM 出版周期:Bimonthly 研究方向:生物 - 生化研究方法 出版语言:English 创刊时间:2000 是否预警:否 出版地区:ENGLAND 是否OA:未开放 期刊介绍 《Briefings In Bioinformatics》(《生物信息学简报》)是一本由Oxford University Press出版的生物-生化研究方法学术刊物,该刊是国际一流期刊,主要刊载...
期刊IF信息 Brief Bioinform 2021年的IF为13.99，今年预测IF为11.45，中科院分区生物学大类2区，版面费约3300美元。总的中国文章占比约34%。平均审稿时间约6个月。自引率11.2%，接收率较低，投稿难度略高。在投稿国家和机构TOP5中，投稿数量最高的国家是中国，第二高是美国；数量最高的机构是欧洲大学联盟，第...
Brief Bioinform:利用基因组测序和AI分析或能揭示隐藏在乳腺癌发病背后的特殊遗传标志物 乳腺癌是如今影响西方女性健康最常见的恶性肿瘤,据估计,有高达10%的乳腺癌病例的发生归因于种系突变(germline variants),然而大多数家族性乳腺癌病例的遗传基础研究人员并不确定,因此发现促进家族性乳腺癌的易感基因或具有一定的...
国际简称:BRIEF BIOINFORM 创刊时间:2000 年发文量:92 出版地:ENGLAND 官网:http://bib.oxfordjournals.org/ 平均6月审稿时间 2区中科院分区 较难平均录用比例 9.101影响因子 生化研究方法小学科 2024年SCI期刊影响因子出炉获取相关优质资源精准匹配期刊 期刊简介中科院分区JCR分区CiteScore影响因子趋势图H-index自引率...
生命科学｜BRIEF BIOINFORM影响因子，是几区 学术期刊《BRIEFINGS IN BIOINFORMATICS》是生命科学研究人员和...
Brief. Bioinform. | 蛋白质-小分子复合物结合强度和配体结合姿态一体预测的深度学习框架 基于结构的药物设计中一项重要的任务是预测配体在靶体口袋中的结合姿态,然而当前已报道的打分函数通常受限于精度,或是局限于单一的输出,比如仅预测构象姿势的偏差(RMSD),结合强度(pKd)或是基于残基-原子间距离分布的统计势。
该综述总结了药物发现领域中分子表示(表征)的演变历程,从最初的人类可读格式,逐步发展到现代的数字描述符、指纹,以及基于序列和图的学习表示。作者强调了各种表示方法在通用性、计算成本、不可逆性和可解释性等方面的优缺点。文章还讨论了药物发现领域的创新机会,包括为高价值、低数据制度创建分子表示,提炼更广泛的...
文章中提出了一种名为ctGAN的生成对抗网络模型,该模型能够结合基因表达数据和生存数据进行转化,并通过样式迁移增强数据,从而提高癌症生存分析的准确性。 关键字:深度迁移、变分自编码器、监督主成分分析 引言 随着人工智能(AI)兴趣的增加,机器学习和深度学习模型在各领域获得了显著关注,特别是在生物医学中。这些模型被...