总结来看,BP、CC、MF分别从功能动态性(过程)、空间定位(结构)和分子机制(活性)三个维度解析基因功能。三者结合可全面揭示基因集在生物学系统中的角色,例如某癌症相关基因集可能在BP上富集“细胞增殖”、CC上定位“细胞膜”、MF上具有“激酶活性”,综合提示其通过膜信号转导...
一、BP、CC、MF在GO富集分析中的含义 生物过程(BP): 描述生物学上发生的一系列事件,如细胞生长、代谢过程、信号传导、细胞周期、细胞死亡、免疫反应等。 在GO富集分析中,BP通常用来描述与疾病或实验条件相关联的基因或蛋白质在哪些生物过程中发挥作用。 细胞组分(CC): 描述基因产物在细胞内的位置,如细胞核、...
1. BP(Biological Process)代表生物过程,涉及基因或蛋白质参与的生物学活动,例如细胞代谢、信号传导等。2. CC(Cellular Component)指的是细胞组成,描述基因或蛋白质在细胞中的位置和结构,例如核内、线粒体等。3. MF(Molecular Function)指的是分子功能,表示基因或蛋白质所具有的化学活性或能力...
首先,使用浏览器(推荐chrome或者edge)打开GO BP、CC、MF三合一双侧条形图绘制页面,左侧为常见作图导航,中间为数据输入框和可选参数,右侧为描述和结果示例。 bioinformatics.com.cn/p 图1.可视化页面 2,示例数据 点击右侧“示例数据”链接下载excel格式的示例数据。 示例数据(仅供参考)包括4列: 第1列是GO term名字...
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BP(BiologicalProcess)、CC(CellularComponent)和MF(MolecularFunction)是基因功能分类的重要概念。BP指生物过程,描述基因或蛋白质参与的生物学活动,如细胞代谢、信号传导等。CC指细胞组成,用于描述基因或蛋白质所在位置和结构,如核内、线粒体等。MF指分子功能,表示基因或蛋白质具有的化学活性或能力...
GO富集分析的结果通常用条形图表示,选择BP、MF、CC中差异基因数大于2的十个条目,条形高度越高,其富集基因数目越多,pvalue值越小。 在这里我们总结了3类常见应用及结构内容,如下所示: 条形图 点击蓝字 关注我们 一、常见柱形图 1. 图例 (一)模板
1.基因富集工具DAVID介绍(一)-基因ID转换 | 2.基因富集工具DAVID介绍(二)-KEGG富集分析 | 3.基因富集工具DAVID介绍(三)-零代码展示KEGG富集结果 | 4.基因富集工具DAVID介绍(四)-GO富集分析及柱形图展示 | 5.GO和KEGG富集分析视频讲解 | 6.KEGG富集分析—柱形图,气
生物过程(bp)、细胞膜组(cc)和分子功能(mf)。生物过程、细胞膜组和分子功能是理解生命活动的基础框架。生物过程指细胞内或细胞间发生的一系列有序活动,比如细胞分裂、能量代谢、信号传递。细胞膜组关注细胞膜的结构成分与组织方式,像磷脂层、蛋白质镶嵌的“拼图”。分子功能描述单个分子在生命活动中扮演的角色,...