本教程介绍了如何使用 R 软件和 ggplot2 包创建箱线图。需要使用函数 geom_boxplot()。一个简化的格式是:geom_boxplot(outlier.colour="black", outlier.shape=16, outlier.size=2, notch=FALSE) outlier…
在统计学中,盒装图(Boxplot)是一种用于显示一组数据分散情况的图表。盒装图通过显示数据的最小值、下四分位数、中位数、上四分位数和最大值等统计量来展示数据的分布情况,同时也可以用来检测异常值。 R语言中的ggplot包提供了丰富的绘图功能,可以非常方便地绘制盒装图。下面我们将介绍如何使用ggplot来画多个盒装...
ggplot2 作图 代码语言:javascript 复制 library(ggplot2) library(stringr) library(ggprism) x_level<-paste(df$Group1,df$Group2,sep="_") x_level df1$group<-str_sub(df1$new_col,5,7) df1$new_col<-factor(df1$new_col, levels = x_level) ggplot(df1,aes(x=new_col,y=value))+ stat_bo...
exprSet2$GAPDH <- scale(exprSet2$GAPDH) 主要包括三个图层,我们按照顺序逐步添加小提琴图、样本散点图与boxplot。每一层都需要注意设置宽度与颜色映射;调整颜色透明度防止过度遮盖。 p <- ggplot(exprSet2, aes(x = PAM50, y = GAPDH)) + #violinplot本体 geom_violin(aes(fill = PAM50),color = NA...
在R语言中,可以使用ggplot2包来绘制qq图和boxplot图。 首先,需要安装ggplot2包,并加载该包: install.packages("ggplot2") library(ggplot2) 复制代码 接下来,可以使用ggplot()函数创建一个基础图形对象,并使用geom_qq()函数来绘制qq图: ggplot(data, aes(sample = variable)) + geom_qq() 复制代码 其中,...
在ggplot()主体,或者geom_XX()中设置fill/color这样的属性参数,需要注意在ggplot(aes(color=..., fill = ...))中为对整体图像的属性设置,在geom_XXX会继承所有在ggplot()主体中的设置。 boxplot可以在ggplot(aes(fill = ...))中设置箱子填充情况,也可以在geom_boxplot(aes(fill = ...))中设置。如下...
ggplot(df1,aes(x=new_col,y=value))+ stat_boxplot(geom = "errorbar",width=0.2)+ geom_boxplot(outlier.shape = 1, aes(fill=group), show.legend = F)+ scale_fill_manual(values = c("#e64b35", "#4daf4a", "#4dbbd5", "#cab2d6", ...
一、ggplot2作图 (复杂) 给某一个基因作图,如ANKLE1 library(ggplot2) #x轴是类型,Y轴是基因表达量 ggplot(group, aes(type,ANKLE1,fill=type))+geom_boxplot() #第一种简化代码 fill表示填充 2.png ggplot(group, aes(type,ANKLE1,color=type))+geom_boxplot() #第二种简化代码 color表示空白颜色 ...
R ggplot2 方法/步骤 1 #读取数据集以ggplot2中的diamonds数据集为例。library(ggplot2)sample1=diamonds[sample(nrow(diamonds),100),]attach(sample1)#当x为分类变量时,plot函数可自动绘制出箱线图plot(cut, price)2 在boxplot函数中,可以使用公式来实现。boxplot(price ~ cut, data = sample1,col=rainbow...
本篇教程将指导你在 R 语言中利用 ggplot2 包绘制箱线图。首先，通过 geom_boxplot() 函数实现基础箱线图构建：1. 准备好你的数据，这是关键步骤。为了更详细展示数据特性，可以利用 stat_summary() 添加平均点：2. 通过选择要展示的项目，定制你的箱线图内容。如果你想在箱线图中添加点状图或...