简单记录一下非conda下载安装bowtie2并配置环境 安装好VMware Workstation 并在虚拟机上安装Ubuntu 打开Terminal 打开桌面路径 wget从网络获取bowtie2最新版本(我个人学习的时候安装过2.2,现在安装好的是2.3.5.1,不过现在已经有2.4版本了,区别应该不会很大……) 前面的‘(base)’是下载运行了conda后显示的,正常情况没...
» Ubuntu » 软件包 » oracular » bowtie2-examples » all » 文件清单 在oracular 发行版中 all 硬件架构下的 bowtie2-examples 软件包文件清单 /usr/share/doc/bowtie2-examples/changelog.Debian.gz /usr/share/doc/bowtie2-examples/copyright /usr/share/doc/bowtie2/examples/index/lambda...
bowtie2_2.3.4.1-1_amd64 NAME bowtie2-build-l - building a colorspace index for bowtie2 SYNOPSIS bowtie2-build-l[options]*<reference_in><bt2_index_base> DESCRIPTION Bowtie 2 version 2.3.4.1 by Ben Langmead (langmea@cs.jhu.edu, www.cs.jhu.edu/~langmea) reference_in comma-separate...
[focal] [jammy] [noble] [oracular] [plucky] [ 源代码:bowtie2] 软件包: bowtie2 (2.5.4-1) [ports] [universe] ultrafast memory-efficient short read aligner 其他与 bowtie2 有关的软件包 下载bowtie2 硬件架构软件包大小安装后大小文件 ...
未经本人授权禁止转载。 1 安装bowtie2 ubuntu上用bin装ok,suse上编译装的,中间包依赖有问题,可用zypper安装所需包 2 安装tophat2 ubuntu上用bin装ok,suse上执行的时候报找不到samtools,但是官网上手册说tophat2不需要samtools。。
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生信分析 bowtie2 沙湖闲人 发消息 AI直接 随意生成表情包 在线stable diffusion Liblib AI 生物软件及应用 (19/23) 自动连播 1.7万播放 简介 订阅合集 VirtualBox配置安装Ubuntu虚拟机 08:26 VB虚拟机备份和迁移 09:23 Linux常用命令 12:25 Linux文件操作命令 11:44 【Linux基础】管道与重定向 09:...
bowtie2下载,从Bowtie download | SourceForge.net网址,网站长这样 我下载的是第一个最新bowtie2-2.4.4,下载方法是点进去,注意要点2.4.4那里,不要点后面。点进去之后长这样 建议大家直接下载源代码,自己make编译一下就行,这样不会有下错OS,版本不兼容等问题。我之所以写了这个小文章,就是想在下面这步给大家提...
/home/ubuntu/output_169_subset/final.contigs.fa Building a SMALL index Reading reference sizes Time reading reference sizes: 00:00:02 Calculating joined length Writing header Reserving space for joined string Joining reference sequences Time to join reference sequences: 00:00:01 bmax according to ...
git=1:2.7.4-0ubuntu1.10 \ bedtools=2.25.0-1 \ python3-pip=8.1.1-2ubuntu0.6 \ vim=2:7.4.1689-3ubuntu1.5 \ unzip=6.0-20ubuntu1.1 \ nano=2.5.3-2ubuntu2 && \ apt-get autoclean && rm -rf /var/lib/apt/lists/* # download, unpack Bowtie2 and Samtools RUN wget -q -O bowtie...