原子之间有键连接,需要设置“bond_style"和“bond_coeff"。 如果模型是用ms建模、设置cvff或者pcff力场导出的data文件,可能会存在“bond_coeff"参数为0的情况,如下图所示: 以harmonic为例,bond力计算公式为: 参数为0,说明bond两端原子受力为0。 虽然两个原子在拓扑关系上有bond连接,但是此bond形同虚设,并不能起...
bond_coeff1harmonic392.80001.6150bond_coeff2fene30.01.51.01.0 (2)在data文件中设置 通过ms导出的data文件,自带cvff或pcff类型的势参数,可在此基础上直接修改。 第一步,同样需要在in文件中指定使用的bond势类型: bond_stylehybridharmonicfene 第二步,在data文件中每个bond的后面添加势类型,并填写对应的势参数。
SPC/E水的bond_coeff里的K值怎么确定?11 2/2 返回列表 上一页 1 2 查看: 1090 | 回复: 13 查看全部回帖@他人 存档 新回复提醒 (忽略) 收藏 在APP中查看 【悬赏金币】回答本帖问题,作者1297985190将赠送您 30 个金币 当前只显示满足指定条件的回帖,点击这里查看本话题的所有回帖 相关版块跳转 分子模拟...
如计算水分子时的命令 bond_style harmonic bond_coeff 1 1000 0.9572 angle_style harmonic ...
bond_coeff2fene30.01.51.01.0 1. 2. (2)在data文件中设置 通过ms导出的data文件,自带cvff或pcff类型的势参数,可在此基础上直接修改。 第一步,同样需要在in文件中指定使用的bond势类型: bond_style hybrid harmonic fene 第二步,在data文件中每个bond的后面添加势类型,并填写对应的势参数。
参数找文献啊，tcl脚本给出的只是键的type,coefficient自己输入不就行了
原子之间有键连接,需要设置“bond_style"和“bond_coeff"。 如果模型是用ms建模、设置cvff或者pcff力场导出的data文件,可能会存在“bond_coeff"参数为0的情况,如下图所示: 以harmonic为例,bond力计算公式为: 参数为0,说明bond两端原子键力为0。 虽然两个原子在拓扑关系上有bond连接,但是此bond形同虚设,并不能起...
Self- and cross-reactions of β-hydroxyperoxy radicals of relevance to tropospheric monoterpene oxidation: structure-activity relationships for rate coeffi... of those peroxy radicals resulting from the OH addition to monoterpenes: the 2-hydroxycyclohexylperoxy c-C 6H 10(OH)O 2 (I), 2-hydroxy-...
D. Lee, L. Cheng, Bond of NSM systems in concrete strengthening - Examining design issues of strength, groove detailing and bond-dependent coefficient, Constr. Build. Mater. 47 (2013) 1512-1522.Dongkeun, L., Lijuan, C.: Bond of NSM systems in concrete strengthening - Examining design ...
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