在blast中E值(E-value)是什么?默认值为10表示比对结果中将有10个匹配序列是由随机产生如果比对的统计显著性值e值小于该值10则该比对结果将被检出换句话说比较低的值将使搜索的匹配要求更严格结果报告中随机产生的匹配序列减少 在blast中E值(E-value)是什么? 一般的,当我们使用BLAST(是一种用于在数据库当寻找...
BLAST中的E值(E-value)是什么意思? BLAST是指Basic Local Alignment Search Tool,是生物信息学中的一种序列比对算法,用于寻找蛋白质或核酸的相似序列。 下面是一个BLAST结果, 后面有两个值,一个是S值,一个E值。可以发现,结果是依据S值的高低来显示的。 S值表示两序列的同源性,分值越高表明它们之间相似的程度...
score值很好理解,即根据不同的打分矩阵,对序列间的匹配程度进行打分,得分矩阵比如PAM和BLOSUM(氨基酸): e-value值的概念看起来就相对的比较模糊了,官方的定义是e-value:the number of hits you expect to see by chance/false positive . 对于定义里面的“by chance”,也就是随机情况下指的是什么意思不是很了解...
blast序列比对中E值是什么意思? E value——E(Expect)值,表示随机匹配的可能性。E值越大,随机匹配的可能性也越大。E值接近零或为零时,具本上就是完全匹配了 E-value - this tells you the probability of getting this sco... E value——E(Expect)值,表示随机匹配的可能性。 E值越大,随机匹配的可能...
blast结构的 e-value什么意思一般的,当我们使用BLAST(是一种用于在数据库当寻找任何蛋白质或者基因序列与你的目标序列一致的程序)时,我们会注意到这里有一个E值。那么这个E value是什么呢?S值表示两序列的同源性,分值越高表明它们之间相似的程度越大。E值就是S值可靠性的评价。它表明在随机的情况下,其它序列与...
E Value 值越小,越可信,相对的一个统计值。这与你所使用的数据库大小有关 Length 输入序列的长度 Identities 一致性,就是两个序列有多少是一样的 Query 代表输入序列 Sbjct 代表数据库中的序列 blast是区段比对,对于给定的两个序列,blast会把具有相识性的片段(hit)找出来,显示的是hit的信息 ...
E期望值(E-value)这个数值表示你仅仅因为随机性造成获得这一比对结果的可能次数。这一数值越接近零,发生这一事件的可能性越小。从搜索的角度看,E值越小,比对结果越显著。默认值为10,表示比对结果中将有10个匹配序列是由随机产生,如果比对的统计显著性值(E值)小于该值(10),则该比对结果将被检出,换句话说,比较...
答:BLAST中利用的统计值有概率p值和期望e值。 E期望值(E-value)那个数值表示你仅仅因为随机性造成取得这一比对结果的可能次数。这一数值越接近零,发生这一事件的可能性越小。从搜索的角度看,E值越小,比对结果越显著。默许值为10,表示比对结果中将有10个匹配序列是由随机产生,若是比对的统计显著性值(E值)小于...
关于BLAST结果中E-value的说法,以下不正确的是A.它表示了相应hit的可信度B.它可以大于1C.当它确定的时候,相应的p-value也是确定的D.它和一开始输入
BLAST是一种用于生物信息学中蛋白质或核酸序列比对的算法,其结果中包含两个关键值:S值与E值。S值反映两序列间的同源性,数值越高表示相似程度越大。E值则是评价S值可靠性的指标,它表示在随机情况下,其他序列与目标序列的相似度超过S值的概率。因此,E值越低,S值的结果越可信。E值的计算公式为...