blastn:用于比对核酸序列(DNA或RNA)与数据库中的核酸序列。输入为核酸序列,输出为相似度高的核酸序列。 blastp:用于比对蛋白质序列与数据库中的蛋白质序列。输入为蛋白质序列,输出为相似度高的蛋白质序列。 blastx:用于比对核酸序列与数据库中的蛋白质序列。输入为核酸序列,输出为相似度高的蛋白质序列。blastx是通...
你进了NCBI的blast页面之后，粘贴进去序列，下面的program selection 选择第三个。结果中有一个“Gallus gallus”，即是家鸡了（应该是从上面数第二个结果）。
CL为数据库名,CL_db为以后blast+搜索时要用到的-db的参数,可以自己起一个有意义的名字/public/home/ztchen/bio_soft/ncbi-blast-2.10.0+/bin/blastn-db $CL_db-query $input_paired.fa-outinput_blastn.out-outfmt6-num_threads
blastn makeblastdb-ina.fasta-dbtype nucl-outa_db #建立参考核苷酸序列索引 blastn-query b.fasta-db a_db-evalue1e-10-outfmt6-max_target_seqs6-outresult #-evalue为阈值,-outfmt为输出格式,-max_target_seqs为最大匹配基因对个数 blastp makeblastdb-ina.fasta-dbtype prot-outa_db #建参考蛋白序列...
nregaloblast 【医】 巨成红细胞, 幼巨红细胞 HR =Hand Radar 携带式雷达 =human resource 人力资源 hr Croatia, 克罗地亚 erythroxyanthraquinone 赤氧基蒽醌 phrenemphraxis 膈神经压轧术 phrethroids 合成除虫菊酸类 tephrochronology 火山灰年代学 thrombokinase,thrombozyme 【化】 因子Xa; 凝血因...
orthochromatic normoblast 正染性幼红细胞,正染性正成红细胞,晚幼红细胞 orthochromatic plate 正色底片 orthochromatic film 正色胶卷,正色胶片 orthochromatic emulsion 正色性乳剂 orthochromatic filter 正色滤光器 bosophilic nregaloblast 【医】 嗜硷性巨成红细胞, 早幼巨红细胞 相似...
Nageotte cell (脑脊液中的一种细胞) 纳热奥特氏细胞 scalariform reticulate thickening (细胞壁) 梯状网纹加厚 intermediate hsg (多缸转子发动机中各相邻缸之间的) 中间缸盖 phase constituent (冒号分类中复合类的组成部分) 相成分 sucking (窑具吸取釉中挥发性成份) 吸釉 epicranial plate (幼虫) 头盖板 mosse...
Nageotte cell (脑脊液中的一种细胞) 纳热奥特氏细胞 epicranial plate (幼虫) 头盖板 Taconic orogeny(晚奥陶世) 太康造山运动 hyposphere (担轮幼虫) 下半球 pharyngeal skeleton (蝇幼虫) 咽骨骼 sucking spear (褐蛉幼虫) 吸矛 相关阅读 便捷的介词用法大全 悲伤时你该说些什么 too和enough该怎么用 7招教...
ACTGGCCAAGTGACCCTCAGCCTGAGTAGCTGGAGTGGTAAGTCAGTGACATGGCAGGAACATCCAGCATCATGCGACTGCTTCTATGTAAACCCTGTATAACTGGGTGGGGGAGGAAAGATGCTGAGGGTGCTGGGTGGGGACCAGCACTGAACTGTCAGCAAGGGATGAAACTGGGCAGTTCTCCACTCACCTTGTTGGGC;要通过NCBI数据库中的blastn寻找与其相似度最高的属于鸡的基因序列,并得到鸡的基因序列的编号:...