BSP克隆测序法(BisulfiteSequencingPCR,BSP) BSP实验原理: BSP克隆测序法,是目前甲基化检测的金标准。用亚硫酸氢盐处理基因组DNA,所有未发生甲基化的胞嘧啶被转化为尿嘧啶,而甲基化的胞嘧啶不变;随后再CpG岛两端设计引物进行PCR,将目的产物纯化后进行TA克隆,每个克隆挑取阳性克隆测序,最后将测得的序列与原始序列比对...
目前,基因的甲基化研究主要结合亚硫酸氢钠处理和PCR技术,分为甲基化特异性PCR(MSP)和硫化测序PCR(BSP)。亚硫酸氢钠处理DNA后,DNA双链中的“C”转化为“U”,随后的PCR中,“U”转化为“T”,但亚硫酸氢盐不能使已发生了甲基化的DNA的“C”发生这种转化。因此,根据经亚硫酸氢盐处理的DNA...
之前文章讲到CpG岛的预测,那如果找到CpG岛后需要检测对应区域的甲基化状态,检测甲基化状态的方法比较多,目前被认为金标准的是亚硫酸盐的测序法(bisulfite sequencing PCR,BSP)。 BSP原理 用亚硫酸氢钠修饰处理基因组DNA,所有未发生甲基化的胞嘧啶(C)被...
网络亚硫氢酸钠修饰测序方法;亚硫酸氢钠测序法;亚硫酸氢盐修饰测序法网络释义 1. 亚硫氢酸钠修饰测序方法 5.采用改良的亚硫氢酸钠修饰测序方法(Bisulfite Sequencing PCR),对早实枳不同发育阶段LFY基因CpG岛区域和非CpG岛区域 …cdmd.cnki.com.cn|基于2个网页 2. 亚硫酸氢钠测序法 亚硫酸氢钠测序法,bisulfite...
使用Promega的T-easy连接试剂盒,将PCR产物与T载体连接,然后转化大肠杆菌感受态细胞。转化后,通过蓝白斑筛选法来选取重组克隆。具体操作包括涂板、划种于新板、孵箱过夜,然后联系测序公司进行测序。以上步骤是全基因组Bisulfite Sequencing的基本流程,每一步都需要仔细操作,确保实验的准确性和可靠性。
亚硫酸氢钠测序法(bisulfite genomic sequencing)是直接测序法的基础,进一步深入研究CpG岛各个位点的甲基化情况。该方法通过重亚硫酸盐使未甲基化的胞嘧啶脱氨基转变成尿嘧啶,而甲基化的胞嘧啶保持不变,进行PCR扩增后,对产物测序并与原始序列对比,从而判断CpG位点是否发生甲基化。这种方法具有高度可靠...
BisulfiteSequencingPCR,BSP是指BSP克隆测序法。BSP实验原理:BSP克隆测序法,是目前甲基化检测的金标准。
亚硫酸氢盐处理后测序(bisulfite sequencing PCR,BSP)法是检测基因甲基化的经典方法, 其原理为:用亚硫酸氢钠修饰处理基因组DNA,所有未发生甲基化的胞嘧***(C)被转化为尿嘧***(U)而甲基化的胞嘧***则不变。 基因组DNA经亚硫酸盐处理后,设计BSP引物扩增目的片段,此时尿嘧***(U)全部转化为胸腺嘧***(T)...
BSP克隆测序法(Bisulfite Sequencing PCR,BSP) ***BSP实验原理:*** BSP克隆测序法,是目前甲基化检测的金标准。用亚硫酸氢盐处理基因组DNA,所有未发生甲基化的胞嘧啶被转化为尿嘧啶,而甲基化的胞嘧啶不变;随后再CpG岛两端设计引物进行PCR,将目的产物纯化后进行TA克隆,每个克隆挑取阳性克隆测序,最后将测得的序列与...
BSP克隆测序法,是目前甲基化检测的金标准。用亚硫酸氢盐处理基因组DNA,所有未发生甲基化的胞嘧啶被转化为尿嘧啶,而甲基化的胞嘧啶不变;随后再CpG岛两端设计引物进行PCR,将目的产物纯化后进行TA克隆,每个克隆挑取阳性克隆测序,最后将测得的序列与原始序列比对,统计甲基化位点及数量,并分析甲基化程度。