1. python pkg: pip install numpy 由于最新版的biom-format还不支持python3,所以需要切换到python2 sudo update-alternatives --config python 然后安装 pip install biom-format 为了处理BIOM 2.0+的文件,需要安装这个: pip install h5py 2. R pkg: 百度,找安装包,安装好依赖即可。 版本: 版本1.0基于JSON格式...
一个接口包BIOM文件格式 Bioconductor版本:版本(3.16) 这是一个R包与BIOM格式。这个包包括基本工具阅读biom-format文件、访问和构造子集数据表从biom对象(这是更复杂的比一个表),以及有限的支持写biom-object回到biom-format文件。这个API的设计是为了匹配python API和其他工具包括biom-format项目,但明显味道“R”R用户...