提取比对上的序列 6. 将提取出来的基因序列全部翻译成蛋白质序列并进行多序列联配(Multiple Sequence Alignment):Crtl+A 全选 -> Sequence -> Translate or Reverse-Translate –> Accessory Application -> ClustalW Multiple Alignment,还可以修改多...
6. 将提取出来的基因序列全部翻译成蛋白质序列并进行多序列联配(Multiple Sequence Alignment):Crtl+A 全选 -> Sequence -> Translate or Reverse-Translate –> Accessory Application -> ClustalW Multiple Alignment,还可以修改多序列联配的配色为自己喜欢的样式。 翻译以及多序列联配 7. 可以方便的预测编码蛋白的...
3、strap NJ Tree Number of bootstraps: pOJOGap penalties: Blank二defaultPairwise olignmcnloMultiple olignmentGap openGap opnGap extendGap extendUther Perometers:Noteherter additiona parameters as 6 single line.BioEdit Sequence Alignment EditorA log file is being generatedIt will be located in ...
Pairwise alignment:可以进行两条序列比对及统计序列相似性。 Nucleic Acid核酸操作选项,包括碱基组成统计,获取反向互补序列,ORF寻找,翻译等等。 Protein操作选项,包括氨基酸组成统计等选项。 Dotplot:两条序列相似性点图。 4)Accessory Application菜单 ClustalW Multiplealignment:可以实现ClustalW多序列比对 出现下面结果: ...
点击Edit并选择 Select All Sequences,现在可以准备对所 有的序列进行比对。3.1.14 点击 Accessory Application 并选择 ClustalW Multiple alignment ,打开一个新窗 5、口。3.1.15 点击窗口下方的 Run ClustalW ,将打开一个新窗口,点 击下方的 OK.3.1.16 序列比对将进行, 进行的时间取决于所要比对的序列的长度...
点击Sequence-Newsequence 将序列粘贴到下面大方框中 注意一定要选择“Sequencetype” 点击Applyand Close,序列就会添加到比对界面 Ctrl+A可以将所有序列一键选中 Ctrl+左键,可以选择自己想比对的序列 最后依次点击 Accessory Application-Cluster W Multiple Alignment-Run Cluster W 为了我们方便我们快速寻找差异位点 点击...
Multiple sequence alignment using Bioedit software was performed using CSFV E2 from the Brescia isolate (GenBank Accession #AF091661) and the BVDV E2 from the NADL isolate (GenBank Accession #AJ133738.1)....
BioEdit 进行多序列比对及结果导出 1、 打开软件 2、 点击 File open 打开需要进行比对的多序列 3、 点击 Edit select all sequence 4、击 Accessory Application Clustalw Multiple alignmen Cl ClustalW Optio ns RBtoronco: T h口m pso, n J ,D. H ig gin, s ClustalW Multicle alianment D.G...
June 1994 P~ Full Muhp g alignrrGnt V : V :Oumut Clustal tormQt */ith CIusIqI consensus sequence cene Qiior^ V Calcula*e NJ Tree I~ FAST dgorithm ioi guide tree P Bootstrap NJ Tree Number of bootstraps: pOJO Gap penalties: Blank二default Pairwise olignmcnlo Multiple olignment ...
2、打开Bioedit程序,点击“File”,选择“Open”,在打开的对话框中选择文件类型为“All Files”,打开序列TXT文件,然后点击菜单栏的“Accessory Application”,在弹出菜单中选择“ClustalW Multiple alignment”,点击“Run ClustalW”,开始进行序列比对。比对结束后,中间数据区的序列发生变化,头尾出现长短不一,这时在“mode...