3.在bioedit里把基因组对应蛋白序列建成本地数据库(这个软件不需要命令操作了,直接傻瓜式一键完成) 4.打开本地Local BLAST,输入选择的比对程序,刚建立的数据库,粘贴或导入种子序列,选择想要的E值,以及比对方法(可以多试试几种,结果整合,反正最后也要验证是否正确)。点击最下方查找即可。 5.根据比对出的结果在基因...
Bioedit提供了本地blast工具（菜单里的local blast 功能），如图一。你需要把基因组数据做成本地数据库，使用菜单里的create a local nucleotide database file功能建立本地DNA数据库，建库的原始数据需要做成fasta格式的，建成的数据库存放在...\bioedit\database文件夹里。然后用另一种菌的基因序列和基...
BLAST:可以进行本地BLAST。先创建数据库(Create a local xx database file),然后比对。(数据库选择all_gene.fa,需要比对序列选择candidate.fa) CAP contig assembly program:可以对多条核酸序列 更多信息参见中文版说明书:
你需要把基因组数据做成本地数据库,使用菜单里的create a local nucleotide database file功能建立本地DNA数据库,建库的原始数据需要做成fasta格式的,建成的数据库存放在...\bioedit\database文件夹里。 然后用另一种菌的基因序列和基因组本地数据库做blastn或者tblastx(图二),就能找到与这个基因序列相似性较高的c...
3. 开始本地 BLAST:在搜索基因组里某一基因家族成员时(如此例中的 pcaF 基因)常用到本地批量序列比对,而 BioEdit 提供了方便友好的本地 BLAST 比对功能。 Ctrl+A 先选中泛基因组所有基因,接着 Accessory Application -> Blast -> Local BLAST,在弹出的窗口中选择比对算法 tblastn(此例中为将种子序列翻译为核酸...
3. 开始本地 BLAST:在搜索基因组里某一基因家族成员时(如此例中的 pcaF 基因)常用到本地批量序列比对,而 BioEdit 提供了方便友好的本地 BLAST 比对功能。 Ctrl+A 先选中泛基因组所有基因,接着 Accessory Application -> Blast -> Local BLAST,...
在boioedit 中如果将一个物种的基因序列进行比对，要把这个物种的很多基因片段一下子单独导出为单个基因...
1.打开BioEdit的序列,选中要复制的序列。 2.在Sequence中选择Extract Positions 3.输入起始位置和结束位置,点OK. 4.键盘按Ctrl+C进行复制,新建一个文件,在File中选择Import from Clipboard。或者直接复制到记事本中。 00分享举报为您推荐 bioedit教程 bioedit使用说明 bioedit下载 bioedit序列比对教程 bioedit序列...
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