BioEdit或者NCBI的本地BLAST软件作BLAST,怎么设置为完全匹配啊?例如,我手头的数据是大小不等的序列例如...
先到: http://130.14.29.110/BLAST/index.shtml 选择 Nucleotide-nucleotide BLAST (blastn) 然后在Search旁边那个大方框里填你要寻找的序列,然后点 BLAST! 然后按 Format! 这时会弹出一个新的窗口,慢慢等个十几秒几十秒……出来的结果会将找到...
2.要有种子序列,也就是Query,对应也是FASTA格式 3.在bioedit里把基因组对应蛋白序列建成本地数据库(这个软件不需要命令操作了,直接傻瓜式一键完成) 4.打开本地Local BLAST,输入选择的比对程序,刚建立的数据库,粘贴或导入种子序列,选择想要的E值,以及比对方法(可以多试试几种,结果整合,反正最后也要验证是否正确)。