而且每个版本都有Python2和Python3的版本,这里我们选择python2的版本,对目前大多数软件兼容更好。 本教程演示使用的测试平台为Ubuntu 16.04,~/bin默认为自己的环境变量目录 # 创建并进入测试目录中的软件目录,请按个人习惯修改 mkdir -p ~/test/soft && cd ~/test/soft 1. 2. 下面Anaconda和Miniconda任选其一即...
而且每个版本都有Python2和Python3的版本,这里我们选择python2的版本,对目前大多数软件兼容更好。 本教程演示使用的测试平台为Ubuntu 16.04,~/bin默认为自己的环境变量目录 # 创建并进入测试目录中的软件目录,请按个人习惯修改 mkdir -p ~/test/soft && cd ~/test/soft 下面Anaconda和Miniconda任选其一即可,这里推...
在Ubuntu:14.04基础Linux环境上安装Bioconda的命令 sudo apt-get update sudo apt-get install wget wget --versio wget https://repo./miniconda/Miniconda2-latest-Linux-x86_64.sh bash Miniconda-latest-Linux-x86_64.sh 全部选择enter或Yes,安装成功 6. source ~/.bashrc 7. conda config --add channels ...
而且每个版本都有Python2和Python3的版本,这里我们选择python2的版本,对目前大多数软件兼容更好。 本教程演示使用的测试平台为Ubuntu16.04,~/bin默认为自己的环境变量目录 代码语言:javascript 复制 # 创建并进入测试目录中的软件目录,请按个人习惯修改 mkdir-p~/test/soft&&cd~/test/soft 下面Anaconda和Miniconda任选...
It is free and easy to install, and it offers free community support. Bioconda is a channel for the conda package manager specializing in bioinformatics software. 它类似于Ubuntu的apt-get,通过它你可以快捷安装许多生物信息的软件,而无需自己解决软件之间的依赖关系。包括fastqc、bwa、tophat、gatk等软件...
这位老兄确实写的狠详细!忍不住转了,win用户还是看原贴把,我把vm装ubuntu那块删了。陆地棉三代出了,意味着我那一大坨RNAseq的结果还要重新跑一遍,先自己鼓捣这把软件安好吧... 软件安装(conda命令安装) Bioconda安装: 要使用conda命令,需要先安装它。(官网https://bioconda.github.io)(这个不知道是怎么回事,点...
Here are the steps to reproduce (in an ubuntu:bionic Docker): wget 'https://repo.anaconda.com/miniconda/Miniconda3-latest-Linux-x86_64.sh' bash Miniconda3-latest-Linux-x86_64.sh source /root/miniconda3/bin/activate conda install r=3.3.1 ...
• a repository of >1500 bioinformatics packages ready to use with conda install • Over 130 contributors that add, modify, update and maintain the recipes 也就会说,它类似于 Ubuntu 和或 RedHat 的 apt-get 或 yum, 通过它你可以快捷安装许多生物信息的软件,而无需自己解决软件之 间的依赖关系。
arepository of >1500 bioinformatics packagesready to use withconda install Over 130 contributors that add, modify, update and maintain the recipes 也就会说,它类似于Ubuntu和或RedHat的apt-get或yum,通过它你可以快捷安装许多生物信息的软件,而无需自己解决软件之间的依赖关系。
bioconda 是一个管理生物信息软件的一个工具软件，可以将 bioconda 当成生物信息软件的AppStore。它基于 ...