选择linux的64位的python2.7版本(共提供win、Mac、linux三种系统,同时支持python3和python2),直接点击下载。或者复制链接后,用wget下载。 wget https://repo.continuum.io/miniconda/Miniconda2-latest-Linux-x86_64.sh 下载完成后,在终端键入bash命令进行安装: bash Miniconda-latest-Linux-x86_64.sh 之后按照提示点...
要安装其他版本,输入:conda install 软件名=版本号; conda install -c jfear sratoolkit conda install fastqc fastqc #测试是否能正常打开该软件 conda install hisat2 hisat2 -h #测试 conda install samtools samtools -help conda install -c bioconda htseq 编辑于 2018-03-29 19:25 Linux 生物信息学 ...
conda install numpy=1.7.2 # 安装特定版本的软件包 conda remove <package name> # 移除软件包 1. 2. 3. 安装R # 具体见下面 conda install -c r r-essentials # 安装R,及80多个常用的数据分析包, 包括idplyr, shiny, ggplot2, tidyr, caret 和 nnet # 安装单个包 # conda install -c https://...
安装好 Bioconda 后，可以查看当前安装的软件。常用命令如：conda list - 列出已安装的软件包。conda update 软件名 - 升级特定软件包。conda remove 软件名 - 卸载指定的软件包。conda search 软件名 - 查询软件包的版本信息。conda install 软件名=版本号 - 安装指定版本的软件包。通过这些命令，用户...
Conda 是一个开源的软件包管理系统和环境管理系统,用于安装多个版本的软件包及其依赖关系,并在它们之间轻松切换,是多个软件包管理器的组合(如 pip,CPAN,CRAN,Bioconductor,apt-get 等),可以在多个操作系统上(包括 Linux,Mac OSX 和 Windows)使用。 Conda 允许用户可以从不同的 channels下载所需的软件包,用户也可以...
bash Miniconda2-latest-Linux-x86_64.sh # Miniconda2 4.5.4 1. 2. 3. 4. 按提示Enter回车、输入yes同意许可协议、默认安装目录为~/miniconda2回车即可;安装结束后提示添加环境变量,一般选no,否则可能会破坏你之前安装的软件依赖关系。如果你是新用户,没什么软件可破坏的,请选yes添加以后使用更方便。
bash Miniconda2-latest-Linux-x86_64.sh # Miniconda2 4.5.4 按提示Enter回车、输入yes同意许可协议、默认安装目录为~/miniconda2回车即可;安装结束后提示添加环境变量,一般选no,否则可能会破坏你之前安装的软件依赖关系。如果你是新用户,没什么软件可破坏的,请选yes添加以后使用更方便。
2017年生信宝典发布了Linux学习 - 又双叒叕一个软件安装方法,现在根据使用经验做一些更新,主要是增加了conda环境的复制、导入和导出功能。最开始是为了培训时,学员更方便搭建流程引入的,现在分享出来,方便更多人使用。 Conda包管理系统 Conda是一种通用包管理系统,旨在构建和管理任何语言的任何类型的软件。通常与Anaconda...
bash Miniconda-latest-Linux-x86_64.sh 之后按照提示点击回车,输入要安装的位置,或者输入yes 输入yes后,还没有完成最后安装,还需要source一下: source ~/.bashrc 输入“conda list”来查看已经安装的软件: 2.添加channels conda config --add channels conda-forge ...
2017年生信宝典发布了Linux学习 - 又双叒叕一个软件安装方法,现在根据使用经验做一些更新,主要是增加了conda环境的复制、导入和导出功能。最开始是为了培训时,学员更方便搭建流程引入的,现在分享出来,方便更多人使用。 Conda包管理系统 Conda是一种通用包管理系统,旨在构建和管理任何语言的任何类型的软件。通常与Anaconda...