1.5.2 r3.3.2_0 https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/cloud/conda-forge 从上面可以看到清华的源版本同步于conda-forge, 都比较老,还是指定r通道安装。 conda install -c r -n r r-essentials=1.6.0 R会安装于conda_path/envs/r/bin中,软链到位于环境变量的目录中即可正常使用。 Conda环境简...
Bioconda需要先安装Miniconda,Miniconda 是一个 Anaconda 的轻量级替代,默认只包含了 python 和 conda,但是可以通过pip和 conda 来安装所需要的包。Miniconda 安装包可以到https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/miniconda/下载。这里是清华源的镜像,要比直接去官网下载速度快。
从上面可以看到清华的源版本同步于conda-forge, 都比较老,还是指定r通道安装。 conda install -c r -n r r-essentials=1.6.0 1. R会安装于conda_path/envs/r/bin中,软链到位于环境变量的目录中即可正常使用。 Conda环境简化运行 为了方便不同环境里面程序的运行,我写了一个shell脚本 (conda_env_run.sh),...
8月22号,让生信小伙伴日顾夜盼的bioconda中国镜像已经在清华tuna镜像源的一个服务器上建成了,感谢清华源和那个去呐喊的小伙伴@hyacz。 镜像地址:https://nanomirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/cloud/bioconda/ 一直一来,小伙伴们倍受bioconda服务器在国外,没有国内镜像,下载软件缓慢,不时报错的煎熬。这个镜像...
从上面可以看到清华的源版本同步于conda-forge, 都比较老,还是指定r通道安装。 conda install-c r-n r r-essentials=1.6.0 R会安装于conda_path/envs/r/bin中,软链到位于环境变量的目录中即可正常使用。 Conda环境简化运行 为了方便不同环境里面程序的运行,我写了一个shell脚本 (conda_env_run.sh),具体运行...
bioconda 是官方版软件源,conda-forge 通道是社区版 conda config--addchannels bioconda conda config--addchannels conda-forge 完成上述步骤会在用户的家目录下创建一个.condarc 文件,并将这些软件源写入该文件。 更改镜像 目前我使用的是清华大学镜像:https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/pkgs/free/ ...
昨天,偶然发现: 8 月 22 号,让生信小伙伴日顾夜盼的 bioconda 中国镜像已经在 清华 tuna 镜像源的一个服务器上建成了,感谢那个去呐喊的小伙伴 @hyacz。 镜 像 地 址: https://nanomirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/cloud/ bioconda/ 一直一来,小伙伴们倍受 bioconda 服务器在国外,没有国内镜 像,...
8月22号,让生信小伙伴日顾夜盼的bioconda中国镜像已经在清华tuna镜像源的一个服务器上建成了,感谢那个去呐喊的小伙伴@hyacz。 镜像地址:https://nanomirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/cloud/bioconda/ 一直一来,小伙伴们倍受bioconda服务器在国外,没有国内镜像,下载软件缓慢,不时报错的煎熬。这个镜像的到来将...
从上面可以看到清华的源版本同步于conda-forge, 都比较老,还是指定r通道安装。 conda install -c r -n r r-essentials=1.6.0 R会安装于conda_path/envs/r/bin中,软链到位于环境变量的目录中即可正常使用。 Conda环境简化运行 为了方便不同环境里面程序的运行,我写了一个shell脚本 (conda_env_run.sh),具体...
channels:-https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/cloud/bioconda/conda-https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/pkgs/free/# Anocanda清华镜像-https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/cloud/msys2/-bioconda-defaults-r-https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/cloud/conda-forge...