一、安装R包的几种方法 1、直接安装 2、找到R包下载地址后安装 3、R包下载到本地后安装 4、命令行安装 二、docker镜像中部分包安装时我遇到的错误及解决方法 三、安装记录 1、install.packages 2、BiocManager::install 3、devtools::install_github 4、 remotes::install_github 5、MetaboAnalystR 参考 一、安...
首先,你需要知道要安装的R包的名称以及具体的版本号。这些信息通常可以在包的官方文档或CRAN页面中找到。 使用BiocManager安装指定版本的R包: 使用BiocManager::install函数时,可以通过version参数来指定要安装的包的版本。以下是一个示例代码: R BiocManager::install("GenomicRanges", version = "1.42.0") 在这个...
3.3 安装R包 代码语言:javascript 复制 package=c("ggplot2","BiocManager")for(pkginpackage){if(!requireNamespace(pkg,quietly=TRUE)){install.packages(pkg)}}options(BIOCONDUCTOR_ONLINE_VERSION_DIAGNOSIS=T)bioc_package=c('ChIPQC','ChIPseeker','DiffBind','clusterProfiler','AnnotationDbi','TxDb.Hsapiens....
BiocManager::install("KEGG.db",ask = F,update = F) BiocManager::install(c("GSEABase","GSVA","clusterProfiler" ),ask = F,update = F) BiocManager::install(c("GEOquery","limma","impute" ),ask = F,update = F) BiocManager::install(c("org.Hs.eg.db","hgu133plus2.db" ),ask = F...
利用BiocManager安装R包 1.首先安装BiocManager包 如果你的R版本为3.6版本,请将版本号设置为version = "3.11" version = "3.12"适用于R 4.0.0 if(!requireNamespace("BiocManager",quietly=TRUE))install.packages("BiocManager")BiocManager::install(version="3.12")library("BiocManager")...
)就轻轻松松解决啦，不过这次居然是仅仅是解决了R自带R包下载问题，使用BiocManager仍然是无法安装R包，...
但是今天有一个学员起初是下载R包无法联网,所以失败,根据我们的经验当然是options(download.file.method = ‘libcurl’)就轻轻松松解决啦,不过这次居然是仅仅是解决了R自带R包下载问题,使用BiocManager仍然是无法安装R包,如下所示: 当然就得根据关键词去搜索啦!
首先加载BiocManager library(BiocManager) 再安装 BiocManager::install("package_name") 大家可以试着安装WGCNA,dplyr,ggplot2,limma,tidyverse,DESeq2等R包,有批量安装的命令 install.packages(c("package1","package2", "package3"))BiocManager::install(c("package1","package2", "package3") ) ...
4.1版本的R安装BiocManager包可以用以下代码（注意将BiocManager的版本号设置为version = "3.13"）：if...
package ‘BiocManager’ is not available (for R version 4.0.2) 1. 2. 3. 4. 5. 6. 7. 8. 9. 10. 搜索了一下报错,看到有人说把https改成http就可以了 试一下就成功了 install.packages("BiocManager", repos = "http://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/CRAN/") ...