总之,该研究在灵芝基因组中发现了一个bHLH-zip转录因子SREBP。DAP-seq鉴定了DNA序列5′-GRVGRVGRVGR-3′为最佳的SREBP结合基序,以及参与GA、麦角甾醇和脂质生物合成的关键靶基因。SREBP过表达菌株的进一步实验研究阐明了SREBP在灵芝三萜类化合物和脂质代谢中的作用及其调控机制。 参考文献:Liu Y, Wu F, Tian R, S...
然后,通过多个物种的基因保守性比对分析,筛选到了调控三萜生物合成的潜在bHLH-zip转录因子甾醇调节元件结合蛋白(SREBP)。 图1. 在全基因组水平上鉴定SREBP的结合位点和基序。 通过DAP-seq分析,在全基因组水平鉴定了转录因子SREBP的结合位点和靶基因。进一步对这些靶基因进行KEGG富集分析,发现包括三萜类化合物合成和脂质...