bHLH (basic helix-loop-helix) 转录因子 是一种普遍存在于动植物中的转录因子家族, 是植物中最大的转录因子家族之一, 具有重要的生物学功能。 1 bHLH 转录因子的结构及分类bHLH转录因子是一类含有basic helix-loop-helix(bHLH) 结构域的转录因子。图 1 为根据 GenBank数据库中果蝇 bHLH 保守结构域氨基酸序列 (...
bHLH家族成员均含有bHLH结构域,该结构域共有50-60个保守氨基酸,包含N端DNA结合区域(basic region)和C端HLH区域(helix loop helix)共两个功能区。植物和动物的bHLH序列比其他真核生物多,其中动物bHLH分为A-F共6类,而植物bHLH蛋白少于动...
RbebHLH家族成员的鉴定通过Blast搜索和对NCBI CD数据库的验证,获得了R. persica基因组中337个候选bHLH序列。排除不含保守bHLH结构域的基因,最终得到142个RbebHLH,命名为RbebHLH1-RbebHLH142(表S1)。其中,140个RbebHLH分布在七个染色体上,有两个RbebHLH未能组装到染色体水平。蛋白质长度在73(RbebHLH33)到960(Rbe...
bHLH转录因子的基本特征 碱性螺旋-环-螺旋(bHLH)转录因子家族是众多植物中关键的转录调控因子,其结构域由50到60个保守氨基酸组成,主要分为两个部分:N端的基本区域和C端的HLH区域。bHLH家族在植物中的功能多样,不仅影响植物的生长发育,还关系到植物对非生物胁迫的反应。 本研究通过高通量基因组测序技术,系统鉴定了中...
同时,因 bHLH 广泛参与调控植物次生代谢产物的合成和积 累,已成为分子生药学和中药生态农业研究的热点.为此,本文进一步总结了近年来研究较为透彻的两种药用植物(丹参 Salvia miltiorrhiza,黄花蒿 Artemisia annua)中 bHLH 基因家族及其成员的研究进展,以期为药用植物 bHLH 基因家族的深入研究提供参考, 并为药用植物的...
近日,《生物技术通报》在线发表了题为《滇山茶bHLH基因家族鉴定及花色形成相关基因筛选》的研究报告。本研究基于滇山茶花瓣全长转录组数据,鉴定bHLH家族成员,利用RNA-seq明确表达特征,结合花青素靶向代谢总量,筛选对滇山茶花色调控的关键bHLH基因。本...
一、水稻中的bHLH转录因子家族 bHLH蛋白质家族(basic Helix-Loop-Helix transcription factor family)是具有相似结构和功能的一类转录因子家族,其主要结构包括bHLH域、DNA结合域和转录激活域。研究表明,在水稻中,bHLH转录因子家族成员较为丰富,且不同成员在水稻生长发育和应答胁迫等方面起着不同的作用。 例如,在水稻胚胎...
bHLH基因家族在生物体的细胞命运控制中起着重要的作用。bHLH蛋白质可以作为转录调节因子,调节其下游基因的表达,从而影响物种的生长发育,和其生命活动。bHLH基因家族也参与很多细胞分化过程的调控,比如:红细胞,肌肉细胞和神经元等。在神经元分化中,Mash1等bHLH基因家族成员可以通过调节腓肠神经元的特定细胞系发挥作用。bHL...
1.2猕猴桃bHLH家族蛋白基序(motif)分析 用MEME在线工具(http://web.mit.edu/meme_v4.11.4/share/doc/meme.html)识别保守基序,参数设置为:保守基序个数为3,重复次数为零次或一次,其他为默认值。 1.3猕猴桃bHLH家族染色体位置和基因重复分析 用TBtools软件根据基因结构注释文件进行基因在染色体上的定位分析,并根据结果...
bHLH家族是一种重要的转录因子家族,其成员具有bHLH(basic Helix-Loop-Helix)结构域,能够通过结合E-box DNA序列的方式与其他TF或DNA结合,参与植物生长发育、抗逆应答等调控过程。目前已报道的水稻bHLH基因一般在各种逆境环境(如高盐、旱灾、低温等)下均有表达调控作用,但目前对水稻bHLH基因抗逆表达谱分析的研究还比较...