单细胞转录组测序(scRNA-seq)是一种在单细胞水平对转录组进行测序分析的高通量测序技术,能够揭示细胞层面的基因表达差异,为研究细胞的异质性提供了有力手段。而TCR/BCR测序是一种用于分析T细胞受体(T cell receptor, TCR)和B细胞受体(B cell receptor, BCR)的高通量测序技术,可以揭示T细胞和B细胞受体的多样性和特...
一、TCR测序原理 TCR是T细胞表面的受体分子,用于识别和结合抗原。TCR由两个重链和两个轻链组成,其特异性由重链的变异区域(V区)决定。TCR测序主要是通过测定V区序列来分析T细胞受体的多样性和克隆性。 1. 提取DNA和RNA 需要从样本中提取T细胞的DNA和RNA。这可以通过标准的分子生物学方法和试剂盒来完成。 2. 扩增...
对于BCR/TCR的克隆型鉴定和表达定量，常规的做法是采用特异性引物扩增BCR和TCR序列并对扩增产物进行高通量测序，也就是免疫组库测序的方法。然而，BCR和TCR本质上也是蛋白编码基因，其转录后形成的mRNA自然可以被转录组测序测到，这也使得基于转录组测序数据分析BCR/TCR免疫组库信息成为可能。分析软件 众所周知，BCR和...
因此重建和恢复TCR的多态性,能够很大程度地减少移植相关的发病率和死亡率。造血干细胞移植后,通过TCR测序能评估T细胞免疫重建状态,移植后早期呈现高多样性的TCR能够应对潜在的高度多样性的非自身抗原,且GVHD和HSCT移植后复发的风险较低,据此能帮助提醒临床医生了解患者免疫恢复...
而在不同疾病条件下免疫组库特别是TCR谱会发生很大变化,对诊断及治疗具有重要的指导意义。人体的适应性免疫系统主要依靠于 T 淋巴细胞和 B 淋巴细胞表面的 T 细胞受体(TCR)和 B 细胞受体(BCR)上的互补决定区(CDR)与 MHC-抗原肽分子进行识别并特异性结合。大量研究表明对 BCR 或 TCR 进行测序可用于诊断 B 或...
tcr和bcr测序原理 TCR和BCR测序原理是基于高通量测序技术,主要包括以下步骤: 1.样品准备:从样品中提取DNA或RNA,并对其进行反转录或PCR扩增,以获取TCR或BCR的编码区序列。 2.文库构建:将扩增得到的DNA或RNA片段进行文库构建,包括末端修复、加入适配体、PCR扩增等步骤。 3.测序:使用高通量测序平台进行测序,常用的...
在实体肿瘤中,可以通过对外周血或肿瘤微环境的BCR/TCR测序,来判断预后标志物或监测治疗反应,也可以通过肿瘤浸润B细胞来描述肿瘤特征进而确定对肿瘤生长和转移的免疫反应。范文示例:BCR抗体库测序应用 | 揭示肿瘤浸润B淋巴细胞免疫特征 2、在自身免疫性疾病中的应用 ...
它们的测序原理是通过对其基因进行测序,从而获得它们的序列信息。这种测序方法被广泛应用于免疫学研究、肿瘤免疫治疗等领域。 TCR和BCR的测序原理基本相似,都是通过PCR(聚合酶链式反应)扩增基因片段,然后进行高通量测序。首先,需要提取目标细胞中的DNA或RNA,并将其逆转录为cDNA。然后,使用专门设计的引物对TCR或BCR基因...
传统的测序方法需要从超过百万个细胞中提取大量基因信息,提供的信息是巨量细胞的”平均值“,对于理解人体细胞的多样性有着明显的局限性。 PureCell单细胞平台 完整的免疫组信息 配对且获得全长的TCR/BCR 双链序列信息 免疫图谱定位 在单细胞分辨率下将免疫谱与抗原特异性结合起来 无偏好高灵敏 具有抗原特异性...
bulk TCR数据分析:接着,使用bulk水平测序数据进一步筛选这些特定条件下高频克隆型,并结合时间队列探究其T细胞免疫动态变化。 联合分析:将scRNA-seq和bulk测序数据的结果进行联合分析,取交集,从而确认与疾病密切相关的目标基因和分子调控机制。 图7 单细胞数据与bulk数据互补分析研究思路 ...