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This is the official development repository for BCFtools. See installation instructions and other documentation here http://samtools.github.io/bcftools/howtos/install.html - samtools/bcftools
(1)bcftools官方文档-http://samtools.github.io/bcftools/bcftools.html#statsbcftools(1) Manual Page (2)简书-生信小书童-https://www.jianshu.com/p/99895c7338b2最全bcftools使用说明--只看本文就够了
bcftools 是samtools 的开发者提供的一款专门操作VCF文件的工具,它可以处理VCF格式,也可以处理VCF对应的二进制文件。 github的地址如下 https://github.com/samtools/bcftools 安装过程如下 wget https://github.com/samtools/bcftools/releases/download/1.8/bcftools-1.8.tar.bz2 tar xjvf bcftools-1.8....
github的地址如下 https://github.com/samtools/bcftools 安装过程如下 wget https://github.com/samtools/bcftools/releases/download/1.8/bcftools-1.8.tar.bz2 tar xjvf bcftools-1.8.tar.bz2cdbcftools-1.8/ ./configure make AI代码助手复制代码 解压缩之后,编译即可。
bcftools 是samtools 的开发者提供的一款专门操作VCF文件的工具,它可以处理VCF格式,也可以处理VCF对应的二进制文件。 github的地址如下 https://github.com/samtools/bcftools 安装过程如下 代码语言:javascript 复制 wget https://github.com/samtools/bcftools/releases/download/1.8/bcftools-1.8.tar.bz2 ...
基因数据处理26之bcftools安装和使用 1.下载: https://github.com/samtools/bcftools 2.安装 make make install 3.结合samtools使用 对排序好的bam数据用samtools生成bcf文件: xubo@xubo:~/xubo/data/testTools/se$ samtools mpileup -ugf ../hs38DH.fa hs2.sort.bam >hs2.bcf...
bcftools filter xx.vcf.gz --regions chr1A:5000-50900 > chr1A_5000-5090.vcf 参考资料: https://www.jianshu.com/p/99895c7338b2 https://www.jianshu.com/p/266c55c87978 http://samtools.github.io/bcftools/bcftools.html https://www.biostars.org/p/95013/...
师兄让下载bcftools,学习一下。 1.下载 电脑太不给力了,wget都没有,用brew下载一个 太慢了,在github直接下载。 https://github.com/samtools/bcftools/releases 安装看readme 共享目录出错, 这个时候就要在/etc/ld.so.conf中加入xxx.so所在的目录。
wget -c https://github.com/samtools/bcftools/releases/download/1.14/bcftools-1.14.tar.bz2 tar xjvf bcftools-1.14.tar.bz2 2、编译 cd bcftools-1.14 ./configure --prefix=/where/you/software/bcftools_1_14/ make make install 3、写到环境变量 ...