这篇论文里放送了一个非常实用的数据库(也可以说是一个在线工具),也就是我们今天要讲的BATMAN-TCM(和蝙蝠没什么关系哈)。 它的全称是A Bioinformatics Analysis Tool for Molecular mechANism of Traditional Chinese Medicine(其实是硬凑出来的BATMAN),也可以说是基于网络药理学的中药作用
BATMAN-TCM数据库(Bioinformatics Analysis Tool for Molecular mechANism of Traditional Chinese Medicine)是一个通过中药复方的组成成分分析化合物与作用靶点的关系,并对作用靶点的作用通路和疾病进行相关联系的中药靶点数据库。它不仅可以用来分析现有中药复方成分分子机制,还可以自定义配方组成成分来进行靶基因预测和网络分...
BATMAN-TCM数据库(Bioinformatics Analysis Tool for Molecular mechANism of Traditional Chinese Medicine)是一个专门设计的在线生物信息学分析工具,致力于研究中药的分子机制。通过BATMAN-TCM,研究者可以分析中药复方的组成成分与化合物、作用靶点之间的关系,同时关联作用靶点与疾病。该数据库不仅支持分析现...
中药研究常⽤的数据库和⽹站:TCMGeneDIT、BATMAN 很多同学从事的是中医药领域的科研,相对来说,中医药发表⽂章⽐较困难,能发到Scientific Reports,Oncotarget和Cellular Physiology and Biochemistry 这种5分上下的杂志上已经⽐较困 难了,虽说这⼏个杂志的声誉不太好,毕竟影响因⼦在这⾥。从基⾦的...
因此,BATMAN-TCM团队研发了首个中药入血成分数据库DCABM-TCM (http://bionet.ncpsb.org.cn/dcabm-tcm/)。该数据库通过手工文献挖掘,首次系统收集中药复方和草药的实验检测到的入血成分以及相应的详细的检测条件;同时支持两种中药入血成为基础的数据分析功能:中药分子作用机制揭示和中药为基础的药物发现(图1)。
从基金的角度来说,大家的总体感觉是中医药方向的基金比较好中,每年基金中标的申请人里面也有一些的没有SCI文章的。今天我们换个角度,梳理下中药研究中常用的数据库和网站。 1.TCMGeneDIT:http://tcm.lifescience.ntu.edu.tw/ 收录的信息包括:中药、基因、疾病、成分和疗效:...
数据库概览 点击网址(bionet.ncpsb.org.cn/bat)进入BATMAN-TCM数据库主页,全称为Bioinformatics Analysis Tool for Molecular mechANism of Traditional Chinese Medicine,是一款用于中草药分子机制挖掘的在线分析工具,于2016年发布,最近一次维护在2020年3月31号。数据库基于中草药成分的靶基因预测结果,进行GO/KEGG功能富...
作者在预测成分和疾病靶点的时候使用了三个数据库BATMAN-TCM,TCMSP和PubChem,这三个数据库都属于点点鼠标就可以做的生信分析。 BATMAN-TCM 在线生物信息学分析工具(BATMANTCM)主要功能包含了以下四大部分 中药成分药物潜在靶点预测 靶点的功能分析,包括生物途径、基因本体功能术语和疾病富集分析 ...
有哪位大神知道为啥BATMAN-TCM数据库打不开吗?同问