其中,`-F 4`表示过滤掉未标记的序列,`-o`指定输出文件的名称,``为要转换的BAM文件。 3.等待转换完成。转换后的FASTA文件将保存在指定的输出文件中。 请注意,samtools工具需要在已安装的情况下使用。您可以通过在终端或命令提示符中输入`samtools --version`来检查是否已安装samtools工具。如果未安装,您需要先下载...
@SQ SN:gi|9629357|ref|NC_001802.1| LN:9181 @RG ID:foo SM:sample @PG ID:Blast2Bam PN:Blast2Bam VN:0.1 CL:../../bin/blast2bam -o results.sam -R @RG\tID:foo\tSM:sample - hiv.fasta test_1.fastq.gz test_2.fastq.gz (...) ERR656485.2 83 gi|9629357|ref|NC_001802.1| 715 60...