解压安装包将下载的安装包解压到本地目录中。 安装vina双击解压后的文件夹中的vina.exe文件,按照提示进行安装。注意在安装过程中选择合适的安装路径。 配置环境变量将vina的执行路径添加到系统的环境变量中,这样可以在任何位置运行vina。根据所使用的操作系统,在环境变量中添加vina的执行路径。 测试vina是否安装成功在终...
1、下载安装包:https://github.com/ccsb-scripps/AutoDock-Vina/releases 以Linux系统为例: 根据自己的操作系统选择 下载完成后,应有红框中的vina文件 2、在命令行运行即可: ./vina_1.2.0_linux_x86_64--help 注意:如果出现报错:bash: ./vina_1.2.5_linux_x86_64: Permission denied ; 请该文件添加执行...
conda install-c conda-forge vina 这行命令安装的是Vina 1.2.3,也就是目前最新版本的Vina。conda的安装包和安装命令时常更改,准备安装的伙伴们建议先在anaconda官网查一下当前conda中那个软件的安装命令。 用这个方法安装完后,每次打开时输入 conda activate vina 打开Vina虚环境,就可以直接用vina命令运行vina了。运...
点击【Install】 安装结束点击【Close】 点击桌面任务栏中的【开始图标】找到python软件后,双击没问题即安装成功 第二步:Autodock、Vina、MGLTools、Pymol安装 Autodock下载网址:https://autodock.scripps.edu/ Vina下载网址ttps://vina.scripps.edu/ MGLTools下载网址:tps://ccsb.scripps.edu/mgltools/downloads/...
Meeko安装方法: $ conda activate vina $ conda install -c conda-forge numpy openbabel $ pip install meeko 操作步骤 本教程以Autodock Vina 1.2.2安装包中自带的例子“FDA认证的抗癌药物imatinib与c-Abl 蛋白进行对接(PDB ID: 1IEP)”作为介绍对象(具体路径:/your/pathway/AutoDock-Vina-1.2.2/example/bas...
安装完成后,用户还需将vina.exe文件复制到一个新建的对接默认文件夹中,并将AutodockTools中的adt文件也复制到该文件夹,以确保Vina能够正常运行。 AutoDock Vina的使用教程 使用AutoDock Vina进行分子对接主要分为以下几个步骤:受体预处理、配体预处理、设置对接盒子、进行对接和对接结果分析...
之前看到说有vina1.2需要编译安装,我嫌麻烦找到了别的方法,使用apt安装,但运行到两个ligand时发现无论如何也无法执行,查看版本才发现我安装的是旧旧版本,故在此记录下安装新版本的过程。 0,旧版本的安装与卸载 代码语言:javascript 复制 apt install autodock-vina #安装的是旧版本,vina--version: v1.1.22011年...
1. **使用sudo安装Vina**：如果你使用的是Ubuntu系统，可以直接通过以下命令进行安装：sudo apt-get install autodock-vina在执行此命令时，系统会提示输入根目录密码。输入密码后，安装过程会自动进行。注意：如果你的计算机不支持sudo操作或使用其他Linux发行版，请尝试使用conda或从GitHub直接下载源代码包...
视频加载失败,可以 刷新 试试 00:00/00:00 评论 还没有人评论过,快来抢首评 发布 AutoDock Vina Win 1.2.5 英文版 安装包+安装教程 科研鹿 发布于:广东省 2024.06.25 11:49 +1 首赞 收藏 AutoDock Vina Win 1.2.5 英文版 安装包+安装教程 推荐视频 已经到底了 热门视频 已经到底了 ...
conda install -c conda-forge vina 建立虚拟环境并激活后，即可顺利安装vina。若需安装linux虚拟机，使用UTM下载并激活rosseta，安装amd64架构，步骤较为复杂，具体操作留待后续详细说明。利用vina进行刚性对接时，需准备蛋白质和受体的pdbqt文件。可使用adfrsuite（在anaconda.org中暂时未找到适用于M1、arm64...