1. 生成 NiTi 晶体结构 - ATOMSK 可以从晶体数据库中读取 NiTi 的晶体结构信息，或者通过手动输入晶格...
一、Atomsk软件官网 Atomsk是一款免费、开源、命令行式程序，致力于分子动力学模拟data文件的创立、操控和格式转换。他不光支持分子动力学可视化和分析软件AtomEye、OVITO等，第一性原理计算软件VASP等、经典势场模拟软件LAMMPS和TEM图像模拟软件DrProbe。Atomsk的官网清晰简单，你所需要的功能均在网页的最上方找到，比如软...
依次运行以下代码,生成Al孪晶晶胞 atomsk--create fcc 4.05 Al orient [11-2] [111] [-110] -duplicate 1 3 1 Al_cell.xsfatomskAl_cell.xsf-mirror0Y-wrapAl_mirror.xsfatomsk--mergeY2Al_cell.xsfAl_mirror.xsfAl_final.xsf 结果如下图所示 (2)建立多晶节点文件 新建一个文本文件polycrystal.txt,...
1.下载安装Atomsk软件 以windows系统为例,新建一个文件夹存储建模文件,将安装目录里的Atomsk.exe文件拷贝到刚才新建的文件内。 开始菜单->cmd,打开命令行输入窗口,使用CD命令进入刚才新建的文件夹。 2.建立Al单胞 Al为fcc类型,晶格常数4.05,使用create命令建立一个Al单胞,结果存储到Al_cell.xsf。 atomsk.exe --c...
lammps初学小白..lammps初学小白打算用atomsk建多晶,看了手册,大概知道了多相多晶的建模,但我需要建的是SiC多晶,挖空30%填入Al,这个替换过程我不知道怎么实现,希望大佬教教我
atomsk多晶建模的原理是先建立一个晶胞,然后编写一个polycrystal.txt文件,设定最终模型的尺寸和晶粒的个数。 atomsk按照晶粒个数随机生成对应的节点node坐标,根据Voronoi算法生成每个晶粒空间,并把最初设定的晶胞填充到晶粒空间内,从而得到多晶文件。 如果把最初的晶胞换成孪晶,最终得到的多晶就是孪晶多晶结构。
atomsk多晶建模的原理是先建立一个晶胞,然后编写一个polycrystal.txt文件,设定最终模型的尺寸和晶粒的个数。 atomsk按照晶粒个数随机生成对应的节点node坐标,根据Voronoi算法生成每个晶粒空间,并把最初设定的晶胞填充到晶粒空间内,从而得到多晶文件。 如果把最初的晶胞换成孪晶,最终得到的多晶就是孪晶多晶结构。
atomsk建立多晶是非常灵活的,可以通过控制盒子的大小以及盒子内晶粒的个数、位置来控制晶粒尺寸。此外还可以通过命令控制每个晶粒的原子排列取向旋转角度等。 首先我们先以随机撒点建立多晶为例。 准备下载好的CuO.cif, 以及控制文件polycrystal.txt;polycrystal.txt内容如下: ...
这个文章以建立长方形Al块为例介绍规则晶体的建模方法,主要的建模过程为: 1.下载安装Atomsk软件 以windows系统为例,新建一个文件夹存储建模文件,将安装目录里的Atomsk.exe文件拷贝到刚才新建的文件内。 开始菜单->cmd,打开命令行输入窗口,使用CD命令进入刚才新建的文件夹。
以windows系统为例,新建一个文件夹存储建模文件,将安装目录里的Atomsk.exe文件拷贝到刚才新建的文件内。 开始菜单->cmd,打开命令行输入窗口,使用CD命令进入刚才新建的文件夹。 2. 建立Al单胞 Al为fcc类型,晶格常数4.05,使用create命令建立一个Al单胞,结果存储到Al_cell.xsf。