ATAC-seq 适用于机制研究,探索信号通路、表型变化、疾病等与基因调控的相关性。并以其简便高效、重复性好等优点,成为研究染色质开放区的有效技术方法。 在表观遗传研究中,ATAC-seq 能够探索表观修饰是否与研究目标有相关性,可通过 Open Chromatin 区域和 Motif 分析寻找参与基因调控的转录因子。ATAC-seq、CUT&Tag ...
ATAC-seq(Assay for Transposase-Accessible Chromatin high throughput sequencing)是一种高通量的分子生物学技术,是2013年由斯坦福大学William J. Greenleaf和Howard Y. Chang实验室开发的用于研究染色体上的开放染色质区域即染色质可及性。 原理:利用转座酶Tn5可结合开放染色质的性质,使用Tn5酶捕获DNA序列,进而上机测序。
单细胞ATAC-seq是研究表观遗传学调控的利器,该技术经常被应用于疾病发生、细胞发育等方面。 Darren A C等人利用单细胞ATAC-seq技术绘制了雄性小鼠13个组织的染色质可及性图谱,发现了85类染色质可及性及约40万个潜在的调节元件,为了解哺乳动物的染色质可及性打下了基础。 首先根据单细胞的染色质可及性的异同将所...
ATACseq, MNaseseq and DNaseseq DNaseseq- 酶消化以从转录因子结合位点周围的开放染色质中提取信号。 MNaseseq- 酶消化以提取代表核小体定位的信号。 ATACseq- 使用转座酶并提供一种同时从单个样本的转录因子结合位点和核小体位置提取信号的方法。 3. Work 在本教程[1]中,我们将使用一些公开的数据来了解R中ATA...
单细胞ATAC-seq是研究表观遗传学调控的利器,该技术经常被应用于疾病发生、细胞发育等方面。 Darren A C等人利用单细胞ATAC-seq技术绘制了雄性小鼠13个组织的染色质可及性图谱,发现了85类染色质可及性及约40万个潜在的调节元件,为了解哺乳动物的染色质可及性打下了基础。
【ATAC-Seq简介】 ATAC-seq(Assay for Transposase-Accessible Chromatin with high throughput sequencing)是2013年由斯坦福大学William J. Greenleaf和Howard Y. Chang实验室开发的用于研究染色质可及性(通常也理解为染色质的开放性)的方法, 原理是通过转座酶Tn5容易结合在开放染色质的特性,然后对Tn5酶捕获到的DNA序列...
ATAC-seq技术是由斯坦福大学的Greenleaf和Chang实验室在2013年开发的一种高通量分子生物学方法，专门用于研究染色体上的开放染色质区域，即染色质可及性。其工作原理基于转座酶Tn5能够结合开放染色质的特性，通过Tn5酶捕获DNA序列并上机测序，从而揭示染色质的可及性。染色质是间期细胞核内DNA、组蛋白、非组...
2106 -- 1:00:14 App Cut&Tag与RNA-seq技术联合分析和案例介绍-第三期 4170 1 1:22:45 App 第三期:ATAC-seq结果数据挖掘和课题设计 3.5万 8 33:10 App 第一期:转录组学结果解析和目的基因挖掘 796 -- 34:44 App ATAC-seq在动物研究中的应用 473 -- 55:51 App 第二期-性别决定机制分析方案...
ATAC-Seq是一种快速检测方法,可通过识别具有开放或可及状态的染色质区域来分析整个基因组的表观遗传概况。ATAC-Seq方法快速,简便,适用于广泛的样品类型,已成为常用的表观遗传学分析方法,并且可以作为更深入的表观遗传学分析的基础。 在ATAC-Seq实验中,用高活性的突变Tn5转座酶处理来自细胞或组织样品的完整细胞核。该...