8. 采用deeptools及IGV进行可视化 对bam文件进行归一化之后可进行IGV可视化,同时将bam文件转化为bw文件 #ls *last.bam |while read id; do > nohup bamCoverage --normalizeUsing CPM -b $id -o ${id%%.*}.last.bw & > done | 怎么样,是不是很简单呢?快来试一试吧! 扫描下方的二维码并点击关注,获取...
1,由于peak注释与注释库及优先级关系密切,因此最终放在paper里边的图,以IGV可视化结果为准。 2,输入peak默认不考虑链,如需更精细地注释,请参考ChIPSeeker R包。 3,默认一个peak仅注释到一个转录本 没有预览就是没有出图/结果,这时请参考示例数据,检查输入数据的格式。或者使用我们提供的小工具pyinstaller打包python...
第十九节课:以cell文章为例 系统讲解单细胞的RNA velocity应用 第二十节课:系统学习linux操作系统 chipseq全流程分析以nature文章为例 包括质控 上数据比对 、MACS2、IGV进行可视化 第二十一节课:chipseq下游的motif富集 不同处理直接的峰值overlap韦恩图 差异paek寻找 peak注释 以cell文章为例超级增强子寻找 第二十二...