达澈单细胞ATAC-seq数据分析软件是由上海达澈生物科技有限公司著作的软件著作,该软件著作登记号为:2024SR1784447,属于分类,想要查询更多关于达澈单细胞ATAC-seq数据分析软件著作的著作权信息就到天眼查官网!
SnapATAC(Single Nucleus Analysis Pipeline for ATAC-seq) 是一个能够快速、准确和全面分析单细胞ATAC-seq数据的R包,它可以对单细胞ATAC-seq数据进行常规的数据降维、聚类和批次校正分析,鉴定远端调控元件并预测其调控的靶基因,调用chromVAR软件进行motif分析,同时还可以将scRNA-seq和scATAC-seq数据进行整合分析等。 Snap...
ATAC-seq表观遗传学分析软件是由深圳华大智造科技股份有限公司著作的软件著作,该软件著作登记号为:2024SR1077151,属于分类,想要查询更多关于ATAC-seq表观遗传学分析软件著作的著作权信息就到天眼查官网!
概述了使用Cicero的单细胞ATAC-Seq分析工作流程。 Cicero可以执行两种主要类型的分析: 构建和分析顺式调节网络。Cicero通过分析共可及性来确定假定的顺式调控相互作用,并使用各种技术来可视化和分析; 一般单细胞染色质可及性分析。Cicero还扩展了软件包Monocle 允许使用单细胞染色质可及性数据识别差异可及性、聚类、可视...
因为中文的资料太少,我于是到NCBI上碰碰运气,结果还真找到了,今年刚推出的一款分析软件:An Easy-to-use Systematic pipeline for ...名为“esATAC”,意思是方便使用的ATAC-Seq分析系统,Bioconductor上能够找到它的使用介绍bioconductor.org/packag。看了目录之后发现它的功能很多,使用起来应该比传统的分析方便,说不定...
cellranger-atac软件是用于处理10x Genomics平台Chromium Single Cell ATAC-seq测序数据的分析流程。该软件主要包括以下四个分析流程: cellranger-atac mkfastq: 该子程序主要将Illumina测序仪产生的原始raw base call (BCL)测序文件转换为FASTQ文件,该命令中封装着bcl2fastq程序。
证券之星消息,近日华大智造(688114)新注册了2个项目的软件著作权,包括《ATAC-seq表观遗传学分析软件V1.4.1》、《数据治理系统V2.3.1》等。今年以来华大智造新注册软件著作权20个,较去年同期减少了4.76%。结合公司2023年年报财务数据,2023年公司在研发方面投入了9.1亿元,同比增11.74%。
证券之星消息,近日华大智造(688114)新注册了2个项目的软件著作权,包括《ATAC-seq表观遗传学分析软件V1.4.1》、《数据治理系统V2.3.1》等。今年以来华大智造新注册软件著作权20个,较去年同期减少了4.76%。结合公司2023年年报财务数据,2023年公司在研发方面投入了9.1亿元,同比增11.74%。
SCALE全称是Single-Cell ATAC-seq analysis vie Latent feature Extraction,从名字中就能知道这个软件是通过隐特征提取的方式分析单细胞ATAC-seq数据。 在文章中,作者从开发者的角度列出了目前的scATAC-seq分析软件,chromVAR, scABC, cisTopic, scVI,发现每个软件都有一定的不足之处,而从我们软件使用者的角度,其实可以...
SnapATAC (Single Nucleus Analysis Pipeline for ATAC-seq) 是一个能够快速、准确和全面分析单细胞ATAC-seq数据的R包，它可以对单细胞ATAC-seq数据进行常规的数据降维、聚类和批次校正分析，鉴定远端调控元件并预测其调控的靶基因，调用chromVAR软件进行motif分析，同时还可以将scRNA-seq和scATAC-seq数据进行...