安装 conda 安装 在Linux上安装Aspera,方便的还是直接通过conda进行安装(已经安装了Anaconda),在需要安装的环境下输入以下命令进行安装: $ conda install-c hcc aspera-cli-y 查看是否安装成功 # 有输出帮助文档则安装成功$ ascp-h 查找密钥(下面使用会用到) ...
[root@PC1 software]# bash ibm-aspera-connect_4.2.12.780_linux_x86_64.sh## 安装 003、切换到普通用户下载 [liujiaxin01@PC1 software]$ ls [liujiaxin01@PC1 software]$wget-c https://d3gcli72yxqn2z.cloudfront.net/downloads/connect/latest/bin/ibm-aspera-connect_4.2.12.780_linux_x86_64.tar....
在Linux上安装Aspera,方便的还是直接通过conda进行安装(已经安装了Anaconda),在需要安装的环境下输入以下命令进行安装: $conda install-chcc aspera-cli-y 查看是否安装成功 # 有输出帮助文档则安装成功$ascp -h 查找密钥(下面使用会用到) $whichascp# 输出下面内容,不同环境不一样,根据自己的来~/software/miniconda...
conda install -c hcc aspera-cli 按照上述的步骤,首先我们要先激活conda的环境,然后使用conda命令进行安装,如图所示,在出现了Proceed([y]/n)?,即是否继续安装时候,输入"y"字符,即可继续安装。 在这里需要注意的是安装完成后需打开提供的链接点击“submit”,同意软件条款。 之后,我们可以检查看看是否安装成功,通过...
1.安装aspera Linux系统安装aspera当然最好使用conda啦。 `conda install -c hcc aspera-cli` 当然你也可以去aspera官网下安装包安装 有Windows/macOS/Linux版本可供下载 安装好了如何下载需要的文件呢?你需要获得SRR号。 EBI网站中可搜索项目号或者SRR号,如PRJEB1787,获得这个项目所有的SRR号。
#使用aspera能够帮助我们批量高速下载转录组等数据,现在使用conda进行安装 conda install -c hcc aspera-cli -y #检查是否安装成功,有东西出来就行 ascp -h #另外看看asperaweb_id_dsa.openssh文件是不是在miniconda3/etc文件夹中,务必确认该文件的位置。
#使用aspera能够帮助我们批量高速下载转录组等数据,现在使用conda进行安装 conda install -c hcc aspera-cli -y #检查是否安装成功,有东西出来就行 ascp -h #另外看看asperaweb_id_dsa.openssh文件是不是在miniconda3/etc文件夹中,务必确认该文件的位置。
二、Aspera的下载和安装 在这里,小果推荐使用conda安装,因为这是最为简单方便的方法,具体的步骤如下: #激活conda环境conda activate rna#安装apseraconda install -c hcc aspera-cli 按照上述的步骤,首先我们要先激活conda的环境,然后使用conda命令进行安装,如图所示,在出现了Proceed([y]/n)?,即是否继续安装时候,...
一、软件安装 使用conda安装 conda install -y -c hcc aspera-cli conda install -y -c bioconda sra-tools whichascp ls -lh ~/miniconda3/etc/asperaweb_id_dsa.openssh# 一定要搞清楚你的软件被conda安装在哪 二、aspera的用法 安装完成以后,可以使用ascp --help来查看软件的帮助文档。
mamba install -y -c hcc aspera-cli whichascp ## 一定要搞清楚你的软件被conda安装在哪,以及它配套的asperaweb_id_dsa.openssh 文件的路径 ls -lh ~/mambaforge-pypy3/envs/download/etc/asperaweb_id_dsa.openssh 可以看到,两个软件是被隔离在两个不同的软件里面,每次使用不同的软件都需要激活它自己所...