步骤2:上传预筛选后的ARG序列数据至online pipeline。 ARGs_OAP_v2.0(步骤1):https://github.com/biofuture/Ublastx_stageone ARGs-OAP在线分析网站(步骤2):http://smile.hku.hk/SARGs The output files can be downloaded as tables listing the abundances of ARGs types/subtypes in different units: “ppm...
【ARGs-OAP v3.0——抗生素抗性基因数据库的更新和分析流程升级 | Engineering】(殷晓乐,郑夏婉 等)由抗生素抗性基因(ARG)编码的抗生素抗性激增,对全球公共卫生构成日益严重的威胁。随着技术的进步,特别是在宏基因组测序的普及方面,科学家们已经获得了高速解读不同样本中ARG谱的能力。为了以高通量的方式分析数千个ARG...