ARF基因家族在植物生长发育中扮演重要角色,影响植物对非生物胁迫的反应,但尚未有研究鉴定和分析颠茄中的ARF基因(AbARF)。因此,我们对颠茄ARF基因家族进行了全基因组鉴定和分析,运用最大似然法(ML)构建了系统发育树,并使用系统发育方法将ARF基因分类为不同的分支。分析了AbARF基因的基本组成,得到了AbARF基因与蛋白质...
水稻和欧美杨ARF蛋白的序列比对,构建系统进化树;根据转录本全长测序数据分析杜仲叶片不同生长时期的ARF基因表达谱,并利用qRT-PCR分析杜仲ARF基因与调控ARF基因的miRNA在不同器官不同发育时期的表达模式.【结果】共鉴定出18个杜仲ARF基因,根据系统进化树可以将EuARFs分为5类;miRNA靶位点分析表明eu-miR160s调控Ⅱ亚族...
苹果生长素响应因子(ARF)基因家族全基因组鉴定及表达分析李慧峰*,冉昆*,何平,王海波,常源升,孙清荣,程来亮,李林光**山东省果树研究所,山东泰安271000摘要:生长素响应因子(auxinresponsefactor,ARF)基因在调控生长素响应基因和生长素信号转导途径以及其它多个生长发育过程具有重要作用。本研究利用BlastP程序比对并获得苹果...
0 3 网络出版时间: 网络出版地址; 大麦 ARF 基因家族的全基因组分析 郭宝健,李赢,袁泽宸,吕超,张新忠,许如根 (江苏省作物遗传生理国家重点实验室培育点/粮食作物现代产业技术协同创新中心/ 教育部植物功能基因组学重点实验室/扬州大学大麦研究所,江苏扬州 225009) 摘要;生长素响应因子(auxin response factor , 八 ...
赵艳 1 ,瓮巧云 1 ,马海莲 1 ,宋晋辉 1 ,袁进成 1 ,王凌云 1 ,董志平 2 ,刘颖慧 1 ( 1 河北北方学院,张家口075000; 2 河北省农林科学院谷子研究所,石家庄050001) 摘要:生长素应答因子(ARF,auxinresponsefactors)是一类可以结合在生长素应答基因启动子部位的转录因子,在植物的 生长发育中起至关重要的...
草莓ARF基因家族的生物信息学分析及MIR167与靶基因研究指导教专业名研究方所在学硕士学位论文基因家族的生物信息学分析及与靶基因ARF6的功能鉴定研究生:王少希指导教师:李贺教授专业名称:果树学研究方向:果树分子生物学所在学院:园艺学院019年6月基因家族的生物信息学
ARF 基因家族在植物生长发育中扮演重要 角色,影响植物对非生物胁迫的反应,但尚未有 研究鉴定和分析颠茄中的 ARF 基因(AbARF). 因此,我们对颠茄 ARF 基因家族进行了全基因 组鉴定和分析 ,运用最大似然法( ML)构建了系 统发育树,并使用系统发育方法将 ARF 基因分 类为不同的分支.分析了 AbARF 基因的基本组 ...
为进一步研究辣椒ARF(Auxin Response Factor)基因家族在其生长发育及逆境胁迫中的作用,利用生物信息学方法从辣椒基因组中鉴定出20个ARF基因,这些基因不均匀地分布在辣椒12条染色体上。进化关系显示辣椒ARF基因可分为ClassⅠ和Ⅱ两大类,进一步可细分为Ⅰa、Ⅰb、Ⅰc、Ⅰd、Ⅰe、Ⅱa和Ⅱb等7个亚类。基因结构图表明...
ARF 家族基因大多包含 B3DNA 结构域、ARF 结构域(Auxin⁃resp)和Aux/IAA 结构 域;同源进化分析表明,小麦ARF 家族基因的旁系同源基因数量明显多于大麦和二穗短柄草。 通过拟南芥数据库比对获得 14 个高同源的根系发育相关的小麦ARF 家族基因,利用二系杂交小麦京麦6号及父母本根系为试材进行干旱胁迫处理及实 时...
生长素响应因子(auxinresponsefactor,ARt)基因在调控生长素响应基因和生长素信号转导途径以及其它多个生长发育过程具有重要作用.本研究利用BlastP程序比对并获得苹果ARF基因家族,通过DNAMAN6.0,MEGA5.0,WebLogo3,Maplnspect和MEME软件对苹果4尺,基因进行分析,采用RT-PCR技术研究基因组织表达情况.结果表明,苹果基因组存在...