In the following example, we convert an existing Docker image to Apptainer format. $ docker pull alpine:3.18.2 $ docker run --rm -v /var/run/docker.sock:/var/run/docker.sock -v$(pwd):/work \ kaczmarj/apptainer build alpine_3.18.2.sif docker-daemon://alpine:3.18.2 ...
$ docker pull alpine:3.18.2 $ docker run --rm -v /var/run/docker.sock:/var/run/docker.sock -v$(pwd):/work \ kaczmarj/apptainer build alpine_3.18.2.sif docker-daemon://alpine:3.18.2 This output.siffile will be owned by root, so you can change ownership: ...
$ apptainer build samtools.sif docker://staphb/samtools $ apptainer build wgcna.sif docker://rcoan/wgcna $ apptainer build WGCNA.sif docker://jpcartailler/iterativewgcna 通过沙箱构建 Apptainer 容器 $ apptainer build --sandbox wgcna/ docker://r-base $ apptainer shell --writable wgcna/ $ ...
简介 Administrate your Docker & Portainer servers on the go. Manage: - Containers - Volumes - Images - Networks Pourtainer does NOT require installing additional software or giving SSH access. 更多 新内容 版本记录 版本1.2.0 Negotiating with the narwhals App 隐私 查看详情 开发者“FarFetched...
$ apptainer build WGCNA.sif docker://jpcartailler/iterativewgcna 通过沙箱构建 Apptainer 容器 $ apptainer build --sandbox wgcna/ docker://r-base $ apptainer shell --writable wgcna/ $ R install.packages("BiocManager") BiocManager::install("WGCNA") ...
虽然Apptainer的安装远不如Docker那么容易,但如果你想在容器中寻找更高的安全性,这可能就是你想要的部署系统。 以下是其安装过程。 要求 Apptainer可以安装在RHEL和基于Ubuntu的Linux发行版上。笔者将用Ubuntu server 22.04进行演示,因此你需要一个该操作系统的运行实例和一个具有sudo权限的用户。
$ apptainer shell docker://ghcr.io/apptainer/lolcow 执行命令 $ apptainer exec lolcow_latest.sif cowsay moo # exec 也适用于 docker:// 、 oras:// 、 library:// 和 shub:// URI。这将创建一个执行命令并消失的临时容器。 $ apptainer exec docker://ghcr.io/apptainer/lolcow cowsay '...
Everything works fine when I run it locally using Docker Compose, but on the HPC cluster, the server doesn't seem to be listening on the port. I've verified that the server starts correctly and prints "Server listening on port 5001...". The server and client are packaged ...
同时,还需要配置Docker镜像和容器运行时参数。启动Apptainer后,可以通过浏览器访问控制台来管理容器和应用程序。以上是从零开始安装和配置Metawrap、PlasmidFinder、PhyloFlash和Apptainer的步骤。在安装过程中,需要注意各个软件的依赖关系和配置要求。同时,也需要注意操作系统的版本和发行版的要求。只有这样,才能顺利完成安装...
Docker nginx 容器云 原创 活成一道光 11月前 38阅读 容器iops 容器云 容器云在master节点上编写/root/wordpress/docker-compose.yaml文件,具体要求如下:(1)容器名称:wordpress;镜像:wordpress:latest;端口映射:82:80;(2)容器名称:mysql;镜像:mysql:5.6;(3)MySQLroot用户密码:123456;(4)创建数据库wordpress...