另外,作者还进一步分析了 APOBEC3 相关的突变特征。对来自 251 个乳腺癌、膀胱癌和淋巴瘤癌细胞系克隆的全基因组序列突变特征的分析表明,APOBEC3A 的敲除减少了 APOBEC3 相关的 SBS2 和 SBS13a/b 突变特征。与之相反,尽管 APOBEC3B 在所有细胞系中与 APOBEC3A 相比具有更高的表达和脱氨酶活性,但APOBEC3B ...
作者进一步研究APOBEC3B的功能发现,在一些肿瘤细胞系中,其缺失可以显著增强APOBEC3A的蛋白质水平、活性以及基因突变。再下来,作者研究肿瘤细胞中内源性APOBEC3对kataegis(聚焦链协同超突变)和omikli(弥漫性超突变)的影响。作者确定,在BRCA细胞中,APOBEC3A,而非APOBEC3B调控绝大部分kataegis和omikli突变。最后,...
艾滋病毒还含有一种名为Vif的蛋白质,用于对抗APOBEC3,它们在细胞内相互对抗。 研究人员试图创造出阻断Vif与APOBEC3相互作用的药物,为蛋白质提供完全灭活艾滋病毒和预防感染所需的额外“增强”,使其能够完全灭活艾滋病毒并防止感染,但这些阻断剂大多无效。 日前,研究人员发现了以前未知的APOBEC3和Vif蛋白之间的相互作用,...
几乎所有这些突变都是APOBEC3脱氨酶 (具有抗病毒功能的宿主酶) 作用的特征。自2017年以来,尼日利亚疾病控制中心一直在报告人类感染MPXV (痘病毒) 的病例。自20世纪70年代观察到首例人间病例以来,MPXV感染主要与婴儿和儿童有关。然而,自2017年以来在尼日利亚观察到的病例中,很少有儿童,病毒主要影响20至50岁的成年...
2022年2月9日,耶鲁大学的Ludmil B.Alexandrov博士等人在《Nature》上发表了一篇“Mapping clustered mutations in cancer reveals APOBEC3 mutagenesis of ecDNA”的文章,文章表明ecDNA上反复出现的APOBEC3诱变很可能是一种抗病毒反应的代表,ecDNA的病毒样结构被当作一种传染源,并被APOBEC3酶攻击。ecDNA含有大量的癌症相关...
APOBEC3酶在膀胱癌的发展中扮演着重要角色。它是一种抗病毒酶,能够在正常细胞和癌细胞中引发DNA突变,这些突变与膀胱癌的发生和进展密切相关。研究表明,APOBEC3通过诱导DNA突变,促进了膀胱癌的早期发展,尤其是在尿路上皮癌中。 问题3: 外染色体DNA(ecDNA)在膀胱癌中有什么意义?
随后,本课题组还体外验证了APOBEC3B诱导产生的TP53热点突变是否具有促进细胞增殖和耐药的能力。结果发现,诱导高表达APOBEC3B可以使DLBCL细胞体外克隆形成能力增强,而对阿霉素敏感性降低。而且,表达这些突变型p53蛋白的DLBCL细胞也对阿霉素敏感性降低。从而...
APOBEC3家族基因在肺腺癌多个阶段的表达分析显示,与正常组织相比A3B在多个时间点(原位腺癌和侵袭性肺腺癌)的表达显著升高。为了进一步揭示A3B在肿瘤进化和治疗耐药性中的作用,本研究通过构建人类A3B转基因小鼠,从而研究由A3B诱导NSCLC的作用机制。 1、A3B抑制EGFR-mut肺癌小鼠模型中肿瘤的生长...
APOBEC3酶库和水平取决于宿主物种、组织,不同的酶对要突变的核苷酸或基序(如二核苷酸或四核苷酸)表现出不同的偏好,有46个SNP呈现突变偏倚,其中26个和15个替换分别为GA>AA和TC>TT。猴痘病毒中不寻常的突变偏倚和丰富的A:T碱基的特征,暗示了非随机驱动因素的可能性,例如APOBEC3。作为DNA胞苷脱氨酶之一,APOBEC3是...