今年7月15日,DeepMind在一篇Nature论文中公布了AlphaFold2的源代码供同行探索,一周后,该公司与合作者发布了由AlphaFold2系统预测的蛋白结构数据库(AlphaFold Protein Structure Database)。该数据库包含了由新一代AlphaFold系统预测的约35万个蛋白结...
今年7月15日,DeepMind在一篇Nature论文中公布了AlphaFold2的源代码供同行探索,一周后,该公司与合作者发布了由AlphaFold2系统预测的蛋白结构数据库(AlphaFold Protein Structure Database)。该数据库包含了由新一代AlphaFold系统预测的约35万个蛋白结构,其中,在人类蛋白质组方面,AlphaFold2对98.5%的(20 296种)人类蛋白的...
今年7月15日,DeepMind在一篇Nature论文中公布了AlphaFold2的源代码供同行探索,一周后,该公司与合作者发布了由AlphaFold2系统预测的蛋白结构数据库(AlphaFold Protein Structure Database)。该数据库包含了由新一代AlphaFold系统预测的约35万个蛋白结构,其中,在人类蛋白质组方面,AlphaFold2对98.5%的(20 296种)人类蛋白的...
用户可以通过Alphafold托管在EMBL的服务器进行查询: AlphaFold Protein Structure Database 或者通过Uniprot查询: 通过搜索找到你想要的蛋白,然后进入详情页,跳转到Structure栏即可看到: 需要注意的是,仅部分常见物种的部分蛋白结构可以通过查询得到,更多的结构则需要自己预测 AlphaFold2源代码 Deepmind团队已经讲AlphaFold2代码...
今年7月15日,DeepMind在一篇Nature论文中公布了AlphaFold2的源代码供同行探索,一周后,该公司与合作者发布了由AlphaFold2系统预测的蛋白结构数据库(AlphaFold Protein Structure Database)。该数据库包含了由新一代AlphaFold系统预测的约35万个蛋白结构,其中,在人类蛋白质组方面,AlphaFold2对98.5%的(20 296种)人类蛋白的...
今天给大家介绍一篇Nature Machine Intelligence期刊的论文“AmoebaContact and GDFold as a pipeline for rapid de novo protein structure prediction”,该工作由清华大学龚海鹏课题组完成。本文提出一种基于机器学习的残基Contact预测方法辅助蛋白质结构从头预测,不仅改善... ...
不过已经有48个物种的大多数蛋白质序列的结构已经预测好了,放在了AlphaFold Protein Structure Database中,AlphaFold Protein Structure Database,使用AlphaFold2之前可以先看看自己想要的预测的蛋白质结构是否已经在数据库中。 参考来源: https://towardsdatascience.com/how-to-deploy-and-interpret-alphafold2-with-minima...
AlphaFold蛋白质结构数据库(the AlphaFold Protein Structure Database)的建立基于国际科学界的诸多贡献,以及 AlphaFold 的复杂算法创新和 EMBL-EBI 在共享世界生物数据方面的数十年经验。DeepMind和EMBL的欧洲生物信息研究所(EMBL-EBI)共同提供了AlphaFold 预测结果的访问服务,以便他人可将之作为一种工具来启动和加速研究,...
历经60多年的努力,结构生物学家已经向国际蛋白质数据库(Protein Data Bank,PDB)中贡献了171588套蛋白...
AlphaFold蛋白质结构数据库(the AlphaFold Protein Structure Database)的建立基于国际科学界的诸多贡献,以及 AlphaFold 的复杂算法创新和 EMBL-EBI 在共享世界生物数据方面的数十年经验。DeepMind和EMBL的欧洲生物信息研究所(EMBL-EBI)共同提供了AlphaFold 预测结果的访问服务,以便他人可将之作为一种工具来启动和加速研究,...