⼆、AlphaFold-Multimer算法原理 AlphaFold-Multimer算法基于深度学习技术，构建了⼀个复杂的神经⽹络模型来预测蛋⽩质的三维结构。该算法主要包括两个阶段：配体设计阶段和结构预测阶段。1.配体设计阶段 在配体设计阶段，AlphaFold-Multimer算法⾸先通过⼀个⾃编码器神经⽹络，从给定的氨基酸序列中学习蛋⽩...
经实践检验发现大部分单体蛋白的结构可以被Alphafold2比较准确地预测出来,但是在生物体内很多蛋白质是以复合体的形式来发挥功能的,因此获知蛋白复合体的结构是更为重要的生物学问题。基于AlphaFold2在预测单体蛋白上优秀的表现,近期AlphaFold2的开发团队DeepMind发布了一
目前已经有多个研究团队通过基于AlphaFold2的框架来预测蛋白质复合体的构象,包括:加多肽linker、修改残基索引、构建RoseTTAfold-AlphaFold2筛选流程等,AlphaFold2的开发团队重新训练了一个专门用于蛋白复合体构象的预测模型--AlphaFold-Multimer,准确率超过了其他的方法
AlphaFold2的出现是蛋白质结构预测领域的一次重大突破,基于AlphaFold2预测结果构建的蛋白结构数据库则进一步提高了其易用性。经实践检验发现大部分单体蛋白的结构可以被Alphafold2比较准确地预测出来,但是在生物体内很多蛋白质是以复合体的形式来发挥功能的,因此获知蛋白复合体的结构是更为重要的生物学问题。基于AlphaFold2...
AlphaFold-Multimer原理介绍 AlphaFold2的出现是蛋白质结构预测领域的一次重大突破,基于AlphaFold2预测结果构建的蛋白结构数据库则进一步提高了其易用性。经实践检验发现大部分单体蛋白的结构可以被Alphafold2比较准确地预测出来,但是在生物体内很多蛋白质是以复合体的形式来发挥功能的,因此获知蛋白复合体的结构是更为重要的...