在开始靶基因功能分析之前,首先需要收集相关的基因数据。这些数据可能来自基因芯片实验、RNA测序或其他高通量实验。收集到的数据需要进行预处理,包括质量控制、数据清洗等步骤,以确保数据的准确性和可靠性。2. 基因注释与数据库选择:使用agriGo工具时,需要选择适当的基因注释数据库。agriGo提供了多种农业相...
首先,针对差异表达基因,agrigo提供了Pathway功能分析功能。通过计算Pvalue来评估Pathway的变化显著性,Pvalue值越小,表明该通路的改变越为显著。同时,工具会生成Pathway通路图,并在图中明确标注出差异表达的基因,便于直观理解基因在这些通路中的作用。其次,agrigo支持基因相关性分析。通过统计不同基因在同...