云序客户于9月13日发表的“Hypoxia regulatesoverall mRNA homeostasis by inducing Met1-linked linear ubiquitination of AGO2in cancer cells”文章,作者通过miRNA-seq、RNA-seq以及RIP-seq等技术揭示了缺氧诱导AGO2发生M1-Ubi修饰,干扰沉默复合物miRISC的活性,最终促进整体mRNA的稳态。该研究首次提出肿瘤低氧微环境调...
Tomasetti, MarcoMonaco, FedericaRubini, CorradoRossato, MarziaDe Quattro, ConcettaBeltrami, CristinaSollini, GiacomoPasquini, ErnestoAmati, MonicaGoteri, GaiaPLoS ONE
ago2 rip实验原理go2 rip实验原理 RIP 实验基本原理: 1. 用抗体或表位标记物捕获细胞核内或细胞质中内源性的RNA结合蛋白。 2. 防止非特异性的RNA的结合。 3. 免疫沉淀把RNA结合蛋白及其结合的RNA一起分离出来。 4.结合的RNA序列通过microarray(RIP-Chip),定量RT-PCR或高通量测序(RIP-Seq)方法来鉴定。
因此,AGO2蛋白功能调节机制尤为重要,如AGO2乙酰化修饰(Oncogene 2019) 和AGO2磷酸化修饰 (Neoplasia2020)等。 在此项工作中,作者首先通过RIP-seq/RNA-seq/miRNA-seq检测发现:低氧条件下,miRNA通路抑制,其靶标mRNA降解阻滞,进而呈现整体性累积。采用定量质谱分析表明:低氧能够促进miRNA通路核心效应分子AGO2蛋白与线...
在此项工作中,作者首先通过RIP-seq/RNA-seq/miRNA-seq检测发现:低氧条件下,miRNA通路抑制,其靶标mRNA降解阻滞,进而呈现整体性累积。采用定量质谱分析表明:低氧能够促进miRNA通路核心效应分子AGO2蛋白与线性泛素化链组装复合物(linear ubiquitin chain assembly complex,LUBAC)相互作用。LUBAC是目前发现的唯一一个介导线性...
研究方法:miRNA-Seq、mRNA-Seq、 RIP-Seq、RIP-qPCR 研究摘要 非小细胞肺癌(NSCLC)是一种高致死性肿瘤,经常对靶向治疗产生耐药性。研究表明,TBK1磷酸化AGO2的S417位点(pS417-AGO2),通过增加microRNA诱导的沉默复合体(miRISC)的形成促进NSCLC的进展。临床NSCLC标本中高水平的pS417-AGO2与不良预后呈正相关。有...
通过RIP-seq/RNA-seq/miRNA-seq检测证实:由TBK1介导的AGO2蛋白S417位点磷酸化能够促进肿瘤细胞中高丰度且具有促癌功能的miRNAs装载形成miRISC复合物,影响肿瘤细胞基因表达格局,增强肿瘤细胞生长、迁移和耐药存活能力。 通过临床大样本检测发...
研究方法:miRNA-Seq、mRNA-Seq、RIP-Seq、RIP-qPCR 研究摘要 非小细胞肺癌(NSCLC)是一种高致死性肿瘤,经常对靶向治疗产生耐药性。研究表明,TBK1磷酸化AGO2的S417位点(pS417-AGO2),通过增加microRNA诱导的沉默复合体(miRISC)的形成促进NSCLC的进展。临床NSCLC标本中高水平的pS417-AGO2与不良预后呈正相关。有趣...
在此项工作中,作者首先通过RIP-seq/RNA-seq/miRNA-seq检测发现:低氧条件下,miRNA通路抑制,其靶标mRNA降解阻滞,进而呈现整体性累积。采用定量质谱分析表明:低氧能够促进miRNA通路核心效应分子AGO2蛋白与线性泛素化链组装复合物(linear ubiquitin chain assembly complex,LUBAC)相互作用。LUBAC是目前发现的唯一一个介导线性...
Moreover, isolation and sequencing by RIP-Seq of ERβ-associated long and small RNAs in the cytoplasm suggests involvement of the nuclear receptor in RISC loading, indicating that it may also be able to directly control mRNA translation efficiency and stability. These results demonstrate that AGO2...