有用p value,也有用adj.p.val,如果得到的差异基因可以在生物学上讲得通 (if it make s sense in biological function, that's ok),那不妨多尝试一下。
clusterProfiler包中的enrichKEGG函数和enrichGO函数的默认p值校正方法为BH法 qvalue enrichKEGG函数和enrichGO函数都包含一个用于富集的函数enricher_internal(这个函数属于R包DOSE),而在enricher_internal里,qvalue是用R包qvalue里的qvalue函数算的,用的是bootstrap方法,bootstrap方法是Storey提出的,所以大概算是Storey...
在统计分析中，p-value、p-adjust和q-value是三个关键概念，它们在检验假设和控制错误率中扮演重要角色。p-value是一个在假设检验中使用的统计量，它衡量在原假设（H0）成立的前提下，观察到特定结果的概率。当p值小于预先设定的阈值（如0.05），这暗示观察结果可能不支持H0，倾向于接受备选假设（H1...
这样我们就可以知道,在同时有p-value和p-adjust时,我们应该选择p-adjust用来作为显著性的阈值。 q-value q-value另有一些区别,它也来自于p-value。 q-value可以简单理解为表示p-value产生假阳性的概率,当q-value < 0.05时,p-value显著的假阳性小于0.05。 q值(q-value)是p值校正后的结果。 可定义为:多重假...
adjust_pvalue(data, p.col = NULL, output.col = NULL, method = "holm") Arguments data a data frame containing a p-value column p.col column name containing p-values output.col the output column name to hold the adjusted p-values method method for adjusting p values (see p.adjust). ...
FDR (False Discovery Rate) :所有主张“阳性”的次数中,错误主张(假阳性)所占的比例E[V/R]。目的:控制假阳性率FPR 如果正确计算了P值,所有P值小于?...常用的方法为BH(Benjaminiand Hochberg)校正。基本思路假设进行?次检验,希望控制FDR使E[V/R]的...
Formula to adjust cell value until another cell equals 0 I have a budget spreadsheet that has a lot of math based on multiplying or dividing by percentages. I need a formula that will generate a value up or down until another cell is equal to 0. For Example: Formula to ...
Loan 4 I would like to be able to easily add or remove accounts from the formula. Say for example I get a second shoe loan. How would I add that into the formula. The bank account and debt account do not need to correspond to each other. For example I could set ...
GetCurrentProcessID 得到当前进程的ID OpenProcessToken 得到进程的令牌句柄LookupPrivilegeValue 查询进程的权限 AdjustTokenPrivileges 判断令牌权限 要对一个任意进程(包括系统安全进程和服务进程)进行指定了写相关的访问权的OpenProcess操作,只要当前进程具有SeDeDebug权限就可以了。要是一个用户是Administrator或是被给予了相...
1) adjust p-value 调整p值2) value adjustment 价值调整3) range-adjusting 幅值调整4) adjustment of parameters 数值调整 例句>> 5) weight adjustment 权值调整 1. Based on this,an approach of term weight adjustment is proposed. 据此,提出一种特征项的权值调整策略,实验结果验证了该方法的有效...