具体而言,ACMG遗传变异分类标准的五个分类如下:1.致病性(Pathogenic):具有高度可能性导致疾病或致命后果的变异。这些变异通常在临床实践中已经被证实与特定病症相关。2.可能致病性(Likely Pathogenic):具有较高可能性导致疾病的变异,但尚未有足够的证据证明其与特定疾病的相关性。3.不确定
ACMG 和 AMP 指南以及 ClinGen 的后续更新规定了分类级别的确定性阈值;可能分类(即 LP 和 LB)被认为至少有 90% 的致病性或良性确定性,最终分类(致病性和良性)至少有 99% 的确定性,而 VUS 分类占据低于 90% 确定性的范围。 2. ...
研究者指出,这主要归功于三种类型的证据的优化:第一,新的公开数据库数据和临床观察;第二,实验室主动生成的新数据,如家庭成员的变异分离分析或RNA检测;第三,改进的证据评估方法,特别是基于机器学习的计算模型。其中,机器学习模型在VUS的重新分类中发挥了重要作用,贡献了约一半的重新分类事件。 研究还发现,不同种族...
几乎所有良性(99.88%)和致病性(99.79%)分类保持不变,超过了ACMG和AMP指南推荐的99%的确定性阈值 (Table 1)。LP变异中99.30%保持LP或被重新分类为致病性,LB变异中99.98%保持LB或被重新分类为良性。LP和LB变异的重新分类确认率分别为99.89%和99.89%,远高于ACMG和AMP指南规定的>90%的确定性阈值 (eFigure in Supple...
遗传病基因检测变异的ACMG评级非常重要,你可曾想过,基因检测中的变异分类并非一成不变?尤其是评级为VUS的变异,文章标题是“Clinical Variant Reclassification in Hereditary Disease Genetic Testing”,作者是 Yuya Kobayashi 等人,2024年11月发表在JAMA Network Open上。文章主要内容是对遗传性疾病基因检测中变异分类的...
遗传病基因检测变异的ACMG评级非常重要,你可曾想过,基因检测中的变异分类并非一成不变?尤其是评级为VUS的变异,文章标题是“Clinical Variant Reclassification in Hereditary Disease Genetic Testing”,作者是 Yuya Kobayashi 等人,2024年11月发表在JAMA Network Open上。文章主要内容是对遗传性疾病基因检测中变异分类的...
然而,这项新研究发现,VUS的评级并非固定不变。通过对327万名个体的基因检测数据进行分析,研究者发现,有4.6%的变异在8年内被重新分类。这意味着,原本标记为VUS的变异,可能随着时间的推移,被重新评估为良性、可能良性、可能致病性或致病性。这种变化对患者来说,可能意味着诊断的修正、治疗方案的调整,甚至家族成员风险...