相同之处:如果按观测到的物种数来衡量丰富度,A的richness=4,B的richness=5,而Chao1和ACE都是高于简单的observed richness的,所以ACE和Chao1都赋予了稀有物种一定的计算权重(即便是单身汉,那也是人呀) 不同之处:ACE考虑的稀有物种范围更广,且做了变异系数和样本覆盖度的校正,看起来更加合理(因为复杂,看不懂的人...
Chao1指数通过计算已观察到的物种数量以及出现一次的物种数量来估算未观察到的物种数量。其公式为:Chao1=Sobs+[(n-1)]xF1x(F1-1)/(2xF2),其中Sobs是已观察到的物种数量,n是样本数量,F1是仅出现一次的物种数量,F2是出现两次的物种数量。ACE指数则基于物种出现频率来估算未观察到的物种数量,其...
Chao1指数 Chao1指数有两个版本。版本1使用了单个丰度的物种数量(即“光棍汉”物种)和双个丰度的物种数量(即“好基友”物种)来计算。版本2在此基础上进行了改进,避免了分母为零的情况,尤其是在微生物多样性计算中更为适用。ACE指数 ACE指数由Chao A和Lee S M在1992年提出。它不仅考虑了稀有物...
关于微生物群落alpha多样性指数,说法错误的是:A.Chao1指数和ACE指数越大,代表群落丰度越大。B.Shannon指数和Simpson指数除了表示丰富度,还表达了
CL、CM和CH组的Chao1、ACE、Shannon和Simpson指数增加。在分类组成中,GFPS干预后,未分类的Muribaculaceae、Alloprevotella和未分类的Lachnospiraceae等产生短链脂肪酸(SCFA)的细菌增加。在线性判别分析效应大小(LEfSe)分析中,CC、CL、CM和CH组的特征菌群显示出显著差异。此外,一些特征菌群与相关能量代谢指标显著相关。